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J-GLOBAL ID：202002224348149599   整理番号：20A1890988

Anthurium huixtlenseとPothos scandens(Pothoideae,Araceae)の完全葉緑体ゲノム:ユニークな逆反復拡大と収縮は進化速度に影響する【JST・京大機械翻訳】

Complete Chloroplast Genomes of Anthurium huixtlense and Pothos scandens (Pothoideae, Araceae): Unique Inverted Repeat Expansion and Contraction Affect Rate of Evolution

著者 (9件)： Abdullah (Department of Biochemistry, Faculty of Biological Sciences, Quaid-I-Azam University, Islamabad, Pakistan) ,  Henriquez Claudia L. (Department of Ecology and Evolutionary Biology, University of California, Los Angeles, Los Angeles, USA) ,  Mehmood Furrukh (Department of Biochemistry, Faculty of Biological Sciences, Quaid-I-Azam University, Islamabad, Pakistan) ,  Carlsen Monica M. (Missouri Botanical Garden, St. Louis, MO, USA) ,  Islam Madiha (Department of Genetics, Hazara University, Mansehra, Pakistan) ,  Waheed Mohammad Tahir (Department of Biochemistry, Faculty of Biological Sciences, Quaid-I-Azam University, Islamabad, Pakistan) ,  Poczai Peter (Finnish Museum of Natural History, University of Helsinki, Helsinki, Finland) ,  Croat Thomas B. (Missouri Botanical Garden, St. Louis, MO, USA) ,  Ahmed Ibrar (Alpha Genomics Private Limited, Islamabad, Pakistan)
資料名： Journal of Molecular Evolution  (Journal of Molecular Evolution)
巻： 88  号： 7  ページ： 562-574  発行年： 2020年 
JST資料番号： B0464B  ISSN： 0022-2844  CODEN： JMEVAU  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 亜科Pothoideaeは生態学的に重要な植物科Araceaeに属する。ここでは,亜科Pothoideaeの2種の葉緑体ゲノム:Anthurium huixtlense(サイズ:163,116bp)とPothosスキャンデンデン(サイズ:164,719bp)を報告する。P.scandensの葉緑体ゲノムは,逆反復(IR)のユニークな収縮と拡大を示し,それによって大きな単一コピー領域(LSC:102,956bp)のサイズを増加させ,小単一コピー領域(SSC:6779bp)のサイズを減少させた。これは,小単一コピー(SSC)領域からのIR領域への移行による多くの単一コピー遺伝子の重複をもたらし,一方,いくつかの複製遺伝子は,大きな単一コピー領域への移行により単一コピーになった。蛋白質コード遺伝子の進化速度は,IRの収縮と膨張によって影響された。IRsと比較して単一コピー領域に存在する遺伝子の高い突然変異率を見出した。著者らは,A.huixtlenseと比較した場合,P.scandensにおけるオリゴヌクレオチド反復の2.3倍増加を見出したが,アミノ酸頻度とコドン使用は類似性を明らかにした。転換突然変異に対する転移の比率は,P.scandensで2.26,A.huixtlenseで2.12であった。トランスバージョン変異は,主に非同義置換で翻訳された。限られた種の系統発生的推論は,Araceae亜科の単系統を示した。本研究は,亜科Pothoideaeおよび科Araceaeにおける葉緑体ゲノムの分子進化に関する洞察を提供する。Copyright The Author(s) 2020 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アミノ酸 ,  遺伝子 ,  コドン ,  タンパク質 ,  *突然変異 ,  系統発生 ,  オリゴヌクレオチド ,  分子進化 ,  生態学 ,  類似性 ,  遺伝子再編成
準シソーラス用語： Pothos ,  *葉緑体ゲノム ,  進化速度 ,  非同義置換 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： Araceae ,  Pothoideae ,  Pothos ,  Anthurium ,  逆反復収縮と膨張 ,  遺伝子再編成 ,  遺伝子進化

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (5件)： 葉緑体ゲノム ,  反復 ,  拡大 ,  収縮 ,  進化速度