抄録/ポイント：
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ABSTRACT Enterococcus faecalisは,動物胃腸(GI)路における一般的な共生細菌であり,現代の健康管理設定におけるヒトの日和見感染の主要な原因である。E.faecalis OG1RFは,ほとんどE.faecalis遺伝子型の頑強な生存特性,内因性抗生物質耐性,および病原性形質を保持する,少数の移動性要素を含むプラスミドフリー株である。GI管における競合適応度,生物膜形成,内因性抗菌剤耐性,および環境における生存に対するコアエンテロコッカス遺伝的決定因子の質問を容易にするために,OG1RFにおける染色体トランスポゾン挿入の配列,配列定義セットを作成した。著者らは,ユニークな単一Himarベースのトランスポゾン挿入を有する一連の変異体を同定するために,Illumina配列決定と組み合わせた直交プール戦略を使用した。突然変異体は,2,651(72.6%)注釈付オープンリーディングフレームの1,926に挿入を含み,仮想蛋白質コード遺伝子の大部分と長さ100bp以上の遺伝子間領域にあり,小RNAをコード化できた。この配列トランスポゾンライブラリーの有用性の原理の証明として,著者らは最大ゲノム被覆のために選択した6,829変異体を含む最小入力プールを作成し,E.faecalis OG1RFにおける胆汁耐性の多数の遺伝的決定因子を同定するために,SMarT(配列定義海洋技術)トランスポゾン配列決定(TnSeq)を用語するアプローチを使用した。これらは以前に胆汁酸耐性および新しい遺伝子座と関連するいくつかの遺伝子を含んでいた。このアレイライブラリーは,比較的少数の変異体を持つゲノムの大きな割合の機能的スクリーニングを可能にし,ボトルネックの潜在的影響を低減し,競合後の変異体の即時回復を可能にする。IMPORTANCは,宿主の外で生存し,経口-糞便透過を介して伝播するEnterococcus faecalisの堅牢な能力,および,その高度な内因性および獲得された抗菌剤耐性は,院内感染性腸球菌感染症の治療をすべて複雑にする。保存されたE.faecalisコアゲノムは,現代の健康管理設定におけるこの細菌の進化のための重要な遺伝的足場として機能し,また興味深いワクチンおよび薬物標的を提供する。E.faecalis OG1RFにおける配列トランスポゾン挿入の大きな収集をマッピングし,OG1RFゲノムの約70%をカバーする明確な変異体の配列ライブラリーを作成した。次に,OG1RFにおける胆汁耐性のコアゲノム決定因子を決定するために,このライブラリーを用いてハイスループットトランスポゾン配列決定実験を行った。この収集は,伝統的およびハイスループットアプローチの両方を用いた包括的,機能的腸球菌ゲノムのための貴重な資源であり,興味ある変異体の即時回復を可能にする。Please refer to the publisher for the copyright holders. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
