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J-GLOBAL ID：202002224571477615   整理番号：20A1589421

清風藤属植物のDNAバーコードに基づく葉緑体配列スクリーニング【JST・京大機械翻訳】

Chloroplast Coding Sequence Selection Based on the DNA Barcoding of the Genus Sabiaceae

著者 (6件)： Yan Fulin (貴州中医薬大学薬学院,貴陽,550025) ,  Wen Di (貴州中医薬大学薬学院,貴陽,550025) ,  Wang Bo (貴州中医薬大学薬学院,貴陽,550025) ,  Xu Wenfen (貴州中医薬大学薬学院,貴陽,550025) ,  Sun Qingwen (貴州中医薬大学薬学院,貴陽,550025) ,  Wei Shenghua (貴州中医薬大学薬学院,貴陽,550025)
資料名： Zhongzi  (Zhongzi)
巻： 39  号： 5  ページ： 25-29  発行年： 2020年 
JST資料番号： C2519A  ISSN： 1001-4705  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 葉緑体遺伝子matK、psbK-psbI、psbA-trnH配列に基づいて、9種類の清風藤属植物のDNAバーコードの実行可能性を分析した。その結果,3つの葉緑体遺伝子のうち,matK(805bp),psbA-trnH(29.7%),変異(46),および簡約情報遺伝子座(32)が最も多かった。種間変異の順位はpsbA-trnH>matK>psbK-psbIであり,種内変異の順序はpsbA-trnH>psbK-psbI>matKであった。遺伝距離分析、barcodinggap分析とWilcoxon順位和検定分析結果により、9種類の清風藤属植物の中で、psbA-trnH配列種内最大変異が種間最小変異より小さく、matK配列種間の差異が大きかった。系統樹解析の結果,3つの配列は部分種を区別でき,matK配列の同定効率は高かった。従って、3つの配列はいずれもこの属植物のDNAバーコードとして適していない。後続の研究において、matKをDNAバーコードの補助配列として、他の候補配列との共同分析を勧め、清風藤属DNAバーコード同定の効率を高める。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *葉緑体 ,  スクリーニング ,  葉緑体遺伝子 ,  簡約化
準シソーラス用語： 遺伝距離 ,  系統解析 ,  *DNAバーコード ,  種内変異 ,  psbA-trnH , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 発生,成長,分化  (EH02030U)

タイトルに関連する用語 (4件)： 植物 ,  DNAバーコード ,  葉緑体 ,  スクリーニング