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J-GLOBAL ID：202002224921087016   整理番号：20A0026920

マリの2つのマラリア流行部位における薬剤耐性分子マーカーとPlasmodium falciparum遺伝的多様性の包括的分析【JST・京大機械翻訳】

A comprehensive analysis of drug resistance molecular markers and Plasmodium falciparum genetic diversity in two malaria endemic sites in Mali

著者 (20件)： Diakite Seidina A. S. (Malaria Research and Training Center, University of Sciences, Technics and Technologies of Bamako (USTTB), Bamako, Mali) ,  Diakite Seidina A. S. (West African Centre for Cell Biology of Infectious Pathogens, University of Ghana, Accra, Ghana) ,  Traore Karim (Malaria Research and Training Center, University of Sciences, Technics and Technologies of Bamako (USTTB), Bamako, Mali) ,  Sanogo Ibrahim (Malaria Research and Training Center, University of Sciences, Technics and Technologies of Bamako (USTTB), Bamako, Mali) ,  Clark Taane G. (Faculty of Infectious and Tropical Diseases, London School of Hygiene and Tropical Medicine, London, UK) ,  Campino Susana (Faculty of Infectious and Tropical Diseases, London School of Hygiene and Tropical Medicine, London, UK) ,  Sangare Modibo (Malaria Research and Training Center, University of Sciences, Technics and Technologies of Bamako (USTTB), Bamako, Mali) ,  Dabitao Djeneba (Malaria Research and Training Center, University of Sciences, Technics and Technologies of Bamako (USTTB), Bamako, Mali) ,  Dara Antoine (Malaria Research and Training Center, University of Sciences, Technics and Technologies of Bamako (USTTB), Bamako, Mali) ,  Konate Drissa S. (Malaria Research and Training Center, University of Sciences, Technics and Technologies of Bamako (USTTB), Bamako, Mali) ,  Doucoure Fousseyni (Malaria Research and Training Center, University of Sciences, Technics and Technologies of Bamako (USTTB), Bamako, Mali) ,  Cisse Amadou (Malaria Research and Training Center, University of Sciences, Technics and Technologies of Bamako (USTTB), Bamako, Mali) ,  Keita Bourama (Malaria Research and Training Center, University of Sciences, Technics and Technologies of Bamako (USTTB), Bamako, Mali) ,  Doumbouya Mory (Malaria Research and Training Center, University of Sciences, Technics and Technologies of Bamako (USTTB), Bamako, Mali) ,  Guindo Merepen A. (Malaria Research and Training Center, University of Sciences, Technics and Technologies of Bamako (USTTB), Bamako, Mali) ,  Toure Mahamoudou B. (Malaria Research and Training Center, University of Sciences, Technics and Technologies of Bamako (USTTB), Bamako, Mali) ,  Sogoba Nafomon (Malaria Research and Training Center, University of Sciences, Technics and Technologies of Bamako (USTTB), Bamako, Mali) ,  Doumbia Seydou (Malaria Research and Training Center, University of Sciences, Technics and Technologies of Bamako (USTTB), Bamako, Mali) ,  Awandare Gordon A. (West African Centre for Cell Biology of Infectious Pathogens, University of Ghana, Accra, Ghana) ,  Diakite Mahamadou (Malaria Research and Training Center, University of Sciences, Technics and Technologies of Bamako (USTTB), Bamako, Mali)
資料名： Malaria Journal (Web)  (Malaria Journal (Web))
巻： 18  号： 1  ページ： 1-9  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7332A  ISSN： 1475-2875  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 薬物耐性はMaliにおけるマラリア制御プログラムの最大の課題の1つである。次世代配列決定(NGS)技術における最近の進歩は,アフリカにおける薬物耐性マラリア寄生虫を追跡する新しい効果的な方法を提供する。Plasmodium falciparum薬剤耐性分子マーカーの多様性と罹患率を,異なるマラリア伝染パターンを有する2つのサイト,MaliにおけるDangassaとNioro-du-Sahelで評価した。Dangassaは強い季節的マラリア伝染を有するが,Nioro-du-Sahelは不安定で短い季節的マラリア伝播を有する。2016年にP.falciparum陽性患者から270の乾燥血液スポット試料(Dangassaにおいて214,Nioro-du-Sahelにおいて56)を収集した。試料をAgena MassARRAY iPLEXプラットフォーム上で分析した。特異的コドンはPfcrt,Pfmdr1,Pfdhfr,Pfdhps,Pfarps10,Pfフェレドキシン,Pfexonuclease,Pfmdr2遺伝子で標的化された。Sangerの101-SNP-バーコード法を用いてP.falciparumの遺伝的多様性を評価し,寄生虫種を決定した。Pfcrt_76Tクロロキン耐性遺伝子型はDangassaで64.4%,Nioro-du-Sahelで45.2%の割合で見られた(p=0.025)。Pfdhfr_51I-59R-108Nピリメタミン耐性遺伝子型は,DangassaとNioro-du-Sahelにおいて,それぞれ14.1%と19.6%であった。Pfdhps_S433-A437-K540-A581-613Aのスルファジアジン耐性遺伝子における突然変異は,Nioro-du-Sahelと比較してDangassaにおいて有意に多かった(p=0.035)。Nioro-du-SahelからのDangassa vs 7%からの分離株の17.8%までは,このハプロタイプにおいて少なくとも2つのコドン置換を持っていた。3つの試料(Dangassaにおいて2つ,Nioro-du-Sahelにおいて1つ)のみにおいて,アジアキン耐性Pfmdr1_N86Y突然変異が同定された。ルメファントリン減少感受性Pfmdr1_Y184F突然変異は,DangassaとNioro-du-Sahelのサンプルの39.9%と48.2%でそれぞれ見つかった。1つのピペラシリン耐性Exo_E415G突然変異はDangassaで見つかったが,アルテミシニン耐性遺伝的背景は同定されなかった。高いP.falciparum多様性が観察されたが,明確な遺伝的凝集はどちらの研究サイトでも見られなかった。感染のより高い多重性は,Nioro-du-Sahelと比較して,COIL(p=0.04)とReal McCOIL(p=0.02)法の両方でDangassaで観察された。本研究は,クロロキンおよびピリメタミン耐性マーカーの高い罹患率ならびにスルファドキシン耐性遺伝子における高いコドン置換率を明らかにした。P.falciparumの高い遺伝的多様性が観察された。これらの観察は,アルテミシニンの使用がDangassaとNioro-du-Sahelの両方に関連していることを示唆している。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *薬物耐性 ,  ターゲティング ,  コドン ,  ハプロタイプ ,  バーコード ,  *マラリア原虫 ,  *遺伝 ,  フェレドキシン ,  遺伝子型 ,  寄生虫 ,  *マラリア ,  凝集 ,  突然変異 ,  遺伝子 ,  *Plasmodium falciparum

著者キーワード (4件)： Plasmodium falciparum ,  薬剤耐性 ,  分子監視 ,  次世代シークエンシング

分類 (1件)： 感染症・寄生虫症一般  (GD01010H)

引用文献 (62件)：

• World malaria report 2018; 2018; CR1; citation_publisher=World Health Organization
• Drug resistance in malaria; 2001; CR2; PB Bloland; citation_publisher=World Health Organization, WHO/CDS/CSR/DRS
• Parasite.; Challenges of drug-resistant malaria; S Sinha, B Medhi, R Sehgal; 21; 2014; 61; 10.1051/parasite/2014059; citation_id=CR3
• Antimalarial drug combination therapy; 2001; CR4; citation_publisher=World Health Organization
• J Infect Dis; Plasmodium falciparum clearance rates in response to artesunate in Malian children with malaria: effect of acquired immunity; TM Lopera-Mesa, S Doumbia, S Chiang, AE Zeituni, DS Konate, M Doumbouya; 207; 2013; 1655-1663; 10.1093/infdis/jit082; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (8件)： マリ ,  マラリア ,  流行 ,  薬剤耐性 ,  分子マーカー ,  Plasmodium ,  遺伝的多様性 ,  分析