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J-GLOBAL ID：202002225590877058   整理番号：20A0662828

(Rxdx)_4とクマリン-(Rxdx)_4共役βシートの安定性とpHスイッチ可能性における疎水性の役割【JST・京大機械翻訳】

The Role of Hydrophobicity in the Stability and pH-Switchability of (RXDX)₄ and Coumarin-(RXDX)₄ Conjugate β-Sheets

著者 (2件)： Weber Ryan (Department of Chemistry, Colorado State University, Colorado, United States) ,  McCullagh Martin (Department of Chemistry, Oklahoma State University, Oklahoma, United States)
資料名： Journal of Physical Chemistry B  (Journal of Physical Chemistry B)
巻： 124  号： 9  ページ： 1723-1732  発行年： 2020年 
JST資料番号： W0921A  ISSN： 1520-6106  CODEN： JPCBFK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： pHスイッチ可能な自己集合材料は生物学的イメージングとセンシング応用において興味がある。ここでは,RXDX(X=Ala,Val,Leu,Ile,Phe)ペプチドのpHスイッチ性とクマリンの光学的性質を組み合わせることにより,これらの材料の理想的な候補となることを提案した。この提案を全原子分子動力学シミュレーションの完全なセットで試験した。最初に,裸の(RXDX)_4系における疎水性残基Xの同一性に対するpH-スイッチの依存性を調べた。疎水性の増加は,繊維を安定化し,次に,システムのpH-スイッチ性を低下させた。この挙動は,単一の疎水性残基がアミノ酸を含むクマリンと置換される系にいくらか移転可能であることが分かった。この場合,X=Alaとの複合体は両pHで不安定であることが分かったが,X=Val,Leu,Ile及びPheとの複合体は少なくとも中性pHで安定なβシートを形成することが分かった。クマリン-(RFDF)_4共役体は,中性および酸性クマリン秩序化分布間で0.884±0.001の最大相対エントロピー値を有することが分かった。したがって,クマリン-(RFDF)_4含有ペプチド配列はpH感知バイオエレクトロニクス材料の理想的な候補であることを明らかにした。Copyright 2020 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 画像処理 ,  *疎水性 ,  ペプチド ,  *β構造 ,  酸性 ,  *共役 ,  アミノ酸配列 ,  複合体 ,  アミノ酸 ,  光学的性質 ,  自己集合 ,  計算機シミュレーション ,  ラクトン ,  芳香族縮合化合物
準シソーラス用語： バイオエレクトロニクス ,  残基 ,  全原子分子動力学シミュレーション , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (3件)： 分子構造  (EB03020Y) ,  固-液界面  (CB12050B) ,  核酸一般  (EB04010U)

物質索引 (1件)： クマリン

タイトルに関連する用語 (7件)： クマリン ,  共役 ,  安定性 ,  pH ,  可能性 ,  疎水性 ,  役割