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J-GLOBAL ID：202002226060045430   整理番号：20A1897151

トランスクリプトームデータ再利用により明らかにされたCOVID-19の免疫および代謝シグネチャー【JST・京大機械翻訳】

Immune and Metabolic Signatures of COVID-19 Revealed by Transcriptomics Data Reuse

著者 (4件)： Gardinassi Luiz G. (Departamento de Biociencias e Tecnologia, Instituto de Patologia Tropical e Saude Publica, Universidade Federal de Goias, Goiania, Brazil) ,  Souza Camila O. S. (Departamento de Analises Clinicas, Toxicologicas e Bromatologicas, Faculdade de Ciencias Farmaceuticas de Ribeirao Preto, Universidade de Sao Paulo, Ribeirao Preto, Brazil) ,  Sales-Campos Helioswilton (Departamento de Biociencias e Tecnologia, Instituto de Patologia Tropical e Saude Publica, Universidade Federal de Goias, Goiania, Brazil) ,  Fonseca Simone G. (Departamento de Biociencias e Tecnologia, Instituto de Patologia Tropical e Saude Publica, Universidade Federal de Goias, Goiania, Brazil)
資料名： Frontiers in Immunology (Web)  (Frontiers in Immunology (Web))
巻： 11  ページ： 1636  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7074A  ISSN： 1664-3224  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： コロナウイルス病19(COVID-19)の現在の流行は,数百万の個体に影響を及ぼし,世界中で数千の死亡を引き起こした。疾患の病態生理は複雑で,ほとんど知られていない。したがって,疾患の進行を促進する分子機構を同定することは,この流行を克服するために重要である。このような問題に取り組むために,最近の研究は,主に体液性免疫の活性化,調節不全I型およびIII型インターフェロン発現,強い先天性免疫応答および炎症性シグナル伝達を示す,COVID-19患者由来の細胞,組織および流体のトランスクリプトームプロファイルを報告している。ここでは,公共トランスクリプトームデータセットを分析するためのロバストな機能的アプローチを用いて,COVID-19の病態生理に関する新しい展望を提供した。さらに,SARS-CoV-1およびインフルエンザA(IAV)ウイルスに感染した個人とCOVID-19患者の転写シグネチャを比較した。末梢白血球における呼吸器ウイルスにより誘導されるコア転写シグネチャを同定したが,有意なI型インターフェロン/抗ウイルス応答の欠如はSARS-CoV-2感染を特性化した。また,ヘム生合成,酸化的リン酸化およびトリプトファン代謝を含む代謝経路に関与する遺伝子のより高い発現を同定した。COVID-19患者からの気管支肺胞洗浄液(BALF)のBTM駆動メタ分析は,好中球とケモカインの有意な濃縮を示し,それは1つの死亡COVID-19患者の肺組織からのデータにおいても有意であった。重要なことに,我々の結果は,末梢単核白血球とBALFの両方における酸化的リン酸化に関連する遺伝子のより高い発現を示し,SARS-CoV-2感染時のミトコンドリア活性の重要な役割を示唆する。まとめると,これらのデータポイントは,COVID-19を制御するために治療的に活用できる免疫病理学的特徴および標的に関するものである。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 白血球 ,  遺伝子 ,  炎症 ,  呼吸器 ,  死 ,  インフルエンザ ,  代謝経路 ,  ロバスト性 ,  好中球 ,  細胞情報伝達 ,  ケモカイン ,  *トランスクリプトーム ,  自然免疫 ,  アミノ酸 ,  窒素複素環化合物 ,  芳香族縮合化合物 ,  第一アミン
準シソーラス用語： 分子機構 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (8件)： COVID-19 ,  トランスクリプトミクス ,  炎症 ,  代謝 ,  SARS-CoV-2 ,  SARS-CoV ,  インフルエンザ ,  酸化的リン酸化

分類 (2件)： 感染症・寄生虫症一般  (GD01010H) ,  ウイルス感染の生理と病原性  (EG04042Y)

物質索引 (1件)： トリプトファン

引用文献 (51件)：

• Ornell F, Schuch JB, Sordi AO, Kessler FHP, Ornell F, Schuch JB, et al. “Pandemic fear” and COVID-19: mental health burden and strategies. Braz J Psychiatry. (2020) 42:232-5. doi: 10.1590/1516-4446-2020-0008
• Zhu J, Ji P, Pang J, Zhong Z, Li H, He C, et al. Clinical characteristics of 3,062 COVID-19 patients: a meta-analysis. J Med Virol. (2020) doi: 10.1002/jmv.25884
• Kim YI, Kim SG, Kim SM, Kim EH, Park SJ, Yu KM, et al. Infection and Rapid Transmission of SARS-CoV-2 in Ferrets. Cell Host Microbe. (2020) 27:704-9.e2. doi: 10.1016/j.chom.2020.03.023
• Gardinassi LG, Arévalo-Herrera M, Herrera S, Cordy RJ, Tran V, Smith MR, et al. Integrative metabolomics and transcriptomics signatures of clinical tolerance to Plasmodium vivax reveal activation of innate cell immunity and T cell signaling. Redox Biol. (2018) 17:158-70. doi: 10.1016/j.redox.2018.04.011
• Gardinassi LG, Garcia GR, Costa CHN, Costa Silva V, de Miranda Santos IKF. Blood transcriptional profiling reveals immunological signatures of distinct states of infection of humans with leishmania infantum. PLoS Negl Trop Dis. (2016) 10:e0005123. doi: 10.1371/journal.pntd.0005123

タイトルに関連する用語 (5件)： トランスクリプトーム ,  データ再利用 ,  免疫 ,  代謝 ,  シグネチャー