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J-GLOBAL ID：202002226502557657   整理番号：20A0592803

深海堆積物から分離した新種Micromonospora orduensis【JST・京大機械翻訳】

Micromonospora orduensis sp. nov., isolated from deep marine sediment

著者 (6件)： Veyisoglu Aysel (Department of Medical Laboratory Techniques, Vocational School of Health Services, Sinop University, Sinop, Turkey) ,  Carro Lorena (Departamento de Microbiologia y Genetica, Edificio Departamental, Campus Miguel de Unamuno, Universidad de Salamanca, Salamanca, Spain) ,  Cetin Demet (Division of Science Education, Department of Mathematics and Science Education, Gazi Faculty of Education, Gazi University, Ankara, Turkey) ,  Igual Jose M. (Instituto de Recursos Naturales y Agrobiologia de Salamanca, Consejo Superior de Investigaciones Cientificas (IRNASA-CSIC), Salamanca, Spain) ,  Klenk Hans-Peter (School of Natural and Environmental Sciences, Newcastle University, Newcastle upon Tyne, UK) ,  Sahin Nevzat (Department of Molecular Biology and Genetics, Faculty of Art and Science, Ondokuz Mayis University, Samsun, Turkey)
資料名： Antonie van Leeuwenhoek  (Antonie van Leeuwenhoek)
巻： 113  号： 3  ページ： 397-405  発行年： 2020年 
JST資料番号： A0564A  ISSN： 0003-6072  CODEN： ALJMAO  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： S2509~Tと指定された新しい放線菌株を,トルコ,Orduの南黒海沿岸のMelet川に沿って45mの深さで浚渫により採取した海洋堆積物から分離した。株の細胞壁ペプチドグリカンはメソ-ジアミノピメリン酸と3-OH-ジアミノピメリン酸を含むことが分かった。検出された全細胞糖はアラビノース,グルコース,ラムノース,リボース及びキシロースであった。S2509~T株の診断リン脂質はジホスファチジルグリセロール,ホスファチジルエタノールアミン,ホスファチジルイノシトール,糖脂質及び2つの未同定リン脂質であることが分かった。主なメナキノンはMK-9(H_8),MK-9(H_6),MK-10(H_8),MK-9(H_4),MK-10(H_4)およびMK-10(H_6)と同定された。主要な細胞脂肪酸はiso-C_16:0,iso-C_15:0および10-メチルC_17:0であることがわかった。菌株の分類学的位置を多相アプローチを用いて確立し,S2509~T株がMicromonospora属に属することを示した。菌株S2509~Tの16S rRNA遺伝子配列に基づく系統発生分析は,それがMicromonospora chok配向 DSM45160~T(99.37%配列類似性)の型株に密接に関連し,Micromonospora inaquosa LB39~T(99.37%),Micromonospora lupini Lupac14N~T(99.23%),Micromonospora taraxaci NEAU-P5~T(99.03%)と系統発生的にクラスター化した。菌株S2509~TのgyrB遺伝子配列に基づく系統発生分析は,M.chokorienis JCM13247~T(96.5%配列類似性)との密接な関係を確認した。全ゲノム配列は,S2509~T株がMicromonospora属の新しい種であることを示し,そのためにMicromonospora orduensis sp. nov.が提案されている。タイプ株はS2509~T(=DSM45926~T=KCTC29201~T)である。Copyright Springer Nature Switzerland AG 2019 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *新種 ,  ホスファチジルエタノールアミン ,  河川 ,  ホスファチジルイノシトール ,  遺伝子 ,  沿岸 ,  *Micromonospora ,  脂肪酸 ,  系統発生 ,  放線菌類 ,  細胞壁 ,  糖脂質 ,  クラスタ化 ,  ペプチドグリカン ,  rRNA遺伝子

著者キーワード (5件)： Micromonospora ,  多相分類学 ,  海底堆積物 ,  16S rRNA遺伝子 ,  GyrB遺伝子

分類 (1件)： 微生物形態学・分類学  (EG03030Y)

タイトルに関連する用語 (3件)： 深海堆積物 ,  新種 ,  Micromonospora