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J-GLOBAL ID：202002227251248135   整理番号：20A1358479

全ゲノム系統学的分析に基づくStaphylococcus aureusクローン複合体8株の改良されたサブタイピング【JST・京大機械翻訳】

Improved Subtyping of Staphylococcus aureus Clonal Complex 8 Strains Based on Whole-Genome Phylogenetic Analysis

著者 (11件)： Bowers Jolene R. ,  Driebe Elizabeth M. ,  Albrecht Valerie ,  McDougal Linda K. ,  Granade Mitchell ,  Roe Chandler C. ,  Lemmer Darrin ,  Rasheed J. Kamile ,  Engelthaler David M. ,  Keim Paul ,  Limbago Brandi M.
資料名： mSphere  (mSphere)
巻： 3  号： 3  ページ： Null  発行年： 2018年 
JST資料番号： W5747A  ISSN： 2379-5042  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： USA300,USA500,およびイベリアクローンを含むクローン複合体8(CC8)におけるStaphylococcus aureusのABSTRACT株は,米国,内部および外部の健康管理設定の両方で一般的な病原体である。CC8株タイピングの方法は,菌株が進化し多様化し,全ゲノム配列決定がCC8内の複数の亜系統に陥ることを示した。本研究では,メチシリン耐性S.aureus(MRSA)とメチシリン感受性S.aureus(MSSA)ゲノムの両方を用いて,全ゲノム配列系統発生に基づく主要な菌株タイプを分類するCC8の菌株命名を明らかにすることを試みた。数十年前からArchaicおよびイベリアクローンの分離株は,主要なCC8系統の最も基本的なクレードを構成し,少なくとも1つのCC8の系統は,主にMSSAで作られ,他のよく知られた菌株タイプUSA500およびUSA300の前に分岐した。また,USA500タイプは以前に記載された「Canadian流行性MRSA」株CMRSA9により分離された2つのクレードを含み,USA500を含む1つのクレードもUSA300クレードを含み,USA300-0114株タイプは単系統群ではないことを示した。さらに,著者らのCC8系統発生に由来する単一ヌクレオチド多型(SNP)を標的とするリアルタイムPCRアッセイを用いた迅速,簡単なCC8株タイピングスキームを提示し,従来のS.aureusタイピング技術上の進化系統に基づくより安定なゲノムマーカーの使用の顕著な利点を示した。このより正確でアクセス可能なS.aureusタイピングシステムは,監視を改善し,この非常に重要な病原体の疫学をよりよく知らせる。IMPORTANCE Staphylococcus aureusは,世界中の主要なヒト病原体である。S.aureus菌株の監視は,それらの広がりの理解と感染予防と制御のインフォーミングに重要である。S.aureus,クローン複合体8(CC8)の最も一般的な系統の1つ,およびS.aureusのタイピングのための現在のツールの不正確さの菌株命名を取り囲む混乱は,監視とソース追跡を困難で,時々誤解する。本研究では,CC8株設計を明確にし,迅速で使いやすいCC8分離株のための新しいタイピングスキームを提案した。このタイピングスキームは,比較的安定なゲノムマーカーに基づいており,従来のタイピング技術よりも優位性を示す。このスキームはS.aureusの疫学的研究を大きく改善する可能性を有する。Please refer to the publisher for the copyright holders. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ヒト ,  系統発生 ,  *黄色ぶどう球菌 ,  *ゲノム ,  *複合体 ,  病原体 ,  *クローン ,  疫学 ,  MRSA ,  MRSA感染症 ,  一塩基多型 ,  芳香族カルボン酸 ,  ラクタム ,  硫黄複素環化合物 ,  フェノールエーテル
準シソーラス用語： MSSA ,  ゲノム配列 ,  クレード ,  分離株 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 微生物検査法  (EG02020G) ,  細菌による動物の伝染病  (FE02023A)

物質索引 (1件)： メチシリン

タイトルに関連する用語 (8件)： ゲノム ,  系統学 ,  分析 ,  Staphylococcus ,  クローン ,  複合体 ,  サブ ,  タイピング