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J-GLOBAL ID：202002227984807224   整理番号：20A0076632

モノメチル化RNAヌクレオシド位置異性体の直接質量分析に基づく同定法とそのrRNA分析への応用【JST・京大機械翻訳】

Method for Direct Mass-Spectrometry-Based Identification of Monomethylated RNA Nucleoside Positional Isomers and Its Application to the Analysis of rRNA

著者 (8件)： Nakayama Hiroshi (Biomolecular Characterization Unit, RIKEN Center for Sustainable Resource Science, Saitama, Japan) ,  Yamauchi Yoshio (Department of Chemistry, Tokyo Metropolitan University, Tokyo, Japan) ,  Nobe Yuko (Department of Chemistry, Tokyo Metropolitan University, Tokyo, Japan) ,  Sato Ko (Department of Chemistry, Tokyo Metropolitan University, Tokyo, Japan) ,  Takahashi Nobuhiro (Department of Biotechnology, Tokyo University of Agriculture and Technology, Tokyo, Japan) ,  Shalev-Benami Moran (Department of Structural Biology, Weizmann Institute of Science, Israel) ,  Isobe Toshiaki (Department of Chemistry, Tokyo Metropolitan University, Tokyo, Japan) ,  Taoka Masato (Department of Chemistry, Tokyo Metropolitan University, Tokyo, Japan)
資料名： Analytical Chemistry  (Analytical Chemistry)
巻： 91  号： 24  ページ： 15634-15643  発行年： 2019年 
JST資料番号： A0395A  ISSN： 0003-2700  CODEN： ANCHAM  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： RNA転写後修飾は,生命のすべてのkdomにおいて一般的であり,様々な核酸塩基位置におけるメチル化と主に関連している。メチル化はRNA核酸塩基上の特異的部位で頻繁に起こり,部位特異的分子間/分子内相互作用を調節するように見える。ここでは,位置的モノメチル化RNAヌクレオシド異性体を同定するために液体クロマトグラフィー-質量分析(LC-MS)を利用する方法を提示する。この方法は,RNAのRNアーゼ分解フラグメントのインソース断片化とその後のタンデム質量分析(MS2)(擬MS~3)のプロファイルを生成し,それらの核内フラグメントイオンプロファイルを真正異性体から誘導されたサインプロファイルと比較することにより位置メチル化核酸塩基異性体間を区別する。方法の検証のために,16S/23S rRNAにおける既知のモノメチル化ヌクレオシド異性体の位置を独立に決定した。この概念の証明として,著者らはさらにこの技術を応用して,世界中の数百万人のヒト血液寄生虫に由来するrRNAにおける塩基修飾ヌクレオシド位置異性体を完全に特性化した。ここで述べた方法は,種々の細胞RNAにおけるRNA修飾プロファイルの描写に非常に有益であり,RNAのサブピコモル量だけを必要とするので,細胞中の微小量で表現されるRNA集団の構造機能研究にも使用できる。Copyright 2020 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *ヌクレオシド ,  分子内相互作用 ,  RNアーゼ ,  寄生虫 ,  *RNA【核酸】 ,  核酸塩基 ,  ヒト ,  タンデム質量分析 ,  キャラクタリゼーション ,  *異性体 ,  LC-MS分析 ,  *メチル化 ,  *rRNA ,  質量分析
準シソーラス用語： RNA修飾 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 核酸一般  (EB04010U)

タイトルに関連する用語 (9件)： メチル化 ,  RNA ,  ヌクレオシド ,  位置異性体 ,  質量分析 ,  同定法 ,  rRNA ,  分析 ,  応用