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J-GLOBAL ID：202002228085167411   整理番号：20A2285392

宇宙船組立施設から分離したクロラムフェニコール耐性Kineococcus rubinsiae sp.nov.の記述【JST・京大機械翻訳】

Description of Chloramphenicol Resistant Kineococcus rubinsiae sp. nov. Isolated From a Spacecraft Assembly Facility

著者 (9件)： Mhatre Snehit (Biotechnology and Planetary Protection Group, Jet Propulsion Laboratory, California Institute of Technology, Pasadena, CA, United States) ,  Singh Nitin K. (Biotechnology and Planetary Protection Group, Jet Propulsion Laboratory, California Institute of Technology, Pasadena, CA, United States) ,  Wood Jason M. (Biotechnology and Planetary Protection Group, Jet Propulsion Laboratory, California Institute of Technology, Pasadena, CA, United States) ,  Parker Ceth W. (Biotechnology and Planetary Protection Group, Jet Propulsion Laboratory, California Institute of Technology, Pasadena, CA, United States) ,  Pukall Ruediger (Leibniz-Institute DSMZ-German Collection of Microorganisms and Cell Cultures, Braunschweig, Germany) ,  Verbarg Susanne (Leibniz-Institute DSMZ-German Collection of Microorganisms and Cell Cultures, Braunschweig, Germany) ,  Tindall Brian J. (Leibniz-Institute DSMZ-German Collection of Microorganisms and Cell Cultures, Braunschweig, Germany) ,  Neumann-Schaal Meina (Leibniz-Institute DSMZ-German Collection of Microorganisms and Cell Cultures, Braunschweig, Germany) ,  Venkateswaran Kasthuri (Biotechnology and Planetary Protection Group, Jet Propulsion Laboratory, California Institute of Technology, Pasadena, CA, United States)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 11  ページ： 1957  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： グラム陽性,コッコイド,運動性,好気性細菌,指定菌株B12Tを,Jet Propulation Laboratory Analymore(Pasadena,CA,米国)から分離した。菌株B12Tはクロラムフェニコール(100μg/mL)に耐性があり,比較的遅い増殖剤(3-5日最適)であった。菌株B12Tは28から32°C,pH7から8,0.5%NaClで最適に増殖することが分かった。脂肪酸メチルエステル分析は,菌株B12Tの主要な脂肪酸が,他のKineococcus種によっても産生されるanteiso C_15:0(66.3%)であることを示した。しかし,アラキドン酸(C_20:4ω6,9,12,16c)はB12TおよびKineococcus glutinatus YIM 75677T株に存在したが,他の全てのKineococcus種には存在しなかった。16S rRNA分析は,菌株B12TがKineococcusラジオトレランと類似の97.9%であり,Kineococcusクレード内に入ることを明らかにした。Angustibacter(93%),Kineosporia(94%から95%),Pseudokineococcus(93%),Quadrisphaera(93%),およびThalassiella(94%)を含むファミリーKinesporiaceaeにおける他の属との低い16S rRNA遺伝子配列類似性(<94%)は,菌株B12Tがこれらの属に属しないことを示した。gyrB遺伝子の系統発生解析は,全ての既知Kineococcus種がB12Tと<86%の配列類似性を示した。多遺伝子座配列と全ゲノム配列分析は,他のKineococcus種を有するB12Tクレードを確認した。菌株B12Tの平均ヌクレオチド同一性は,他のKineococcus種で75~78%であり,一方,Kinesporiaceae科内の他の属からの種で72~75%の範囲であった。平均アミノ酸同一性は他のKineococcus種で66~72%であったが,他の属由来の種では50~58%であった。菌株B12TゲノムとKineococcusのメンバーとのdDDH比較は,20-22%の類似性を示し,B12Tが属の他のメンバーと離れて関連することを示した。さらに,WGS由来の全プロテオームの解析は,KinesporilessのB12T株から由来し,B12T株がKinesporiaceae科の新しいメンバーであることを確認した。これらの分析と他のゲノム特性に基づいて,菌株B12TをKineococcus属の新種に割り当て,Kineococcus rubinsiae sp.nov.と命名した。タイプ歪はB12T(=FJII-L1-CM-PAB2T;NRRL B-65556T,DSM110506T)である。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 細菌 ,  塩化ナトリウム ,  脂肪酸 ,  ヌクレオチド ,  系統発生 ,  ゲノム ,  好気性菌 ,  成長因子 ,  *新種 ,  プロテオーム
準シソーラス用語： 16S rRNA ,  ゲノム配列 ,  遺伝子配列 ,  gyrB遺伝子 ,  クレード , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 抗生物質耐性細菌 ,  ゲノム ,  クリーンルーム ,  宇宙船組立施設 ,  Kineococcus rubinsiae

分類 (1件)： 微生物形態学・分類学  (EG03030Y)

引用文献 (59件)：

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• Chun J., Oren A., Ventosa A., Christensen H., Arahal D. R., Da Costa M. S., et al (2018). Proposed minimal standards for the use of genome data for the taxonomy of prokaryotes. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 68 461-466. doi: 10.1099/ijsem.0.002516

タイトルに関連する用語 (5件)： 宇宙船 ,  組立 ,  施設 ,  クロラムフェニコール耐性 ,  記述