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J-GLOBAL ID：202002228188467867   整理番号：20A1934710

リン酸化部位のアロステリックカップリングを介したクライアントキナーゼとのHsp90-Cdc37調節複合体におけるコミュニケーションスイッチング機構の探索:残基相互作用ネットワークの摂動ベースモデリングと階層的コミュニティ解析【JST・京大機械翻訳】

Exploring Mechanisms of Communication Switching in the Hsp90-Cdc37 Regulatory Complexes with Client Kinases through Allosteric Coupling of Phosphorylation Sites: Perturbation-Based Modeling and Hierarchical Community Analysis of Residue Interaction Networks

著者 (4件)： Stetz Gabrielle (Graduate Program in Computational and Data Sciences, Keck Center for Science and Engineering, Schmid College of Science and Technology, Chapman University, California, United States) ,  Astl Lindy (Graduate Program in Computational and Data Sciences, Keck Center for Science and Engineering, Schmid College of Science and Technology, Chapman University, California, United States) ,  Verkhivker Gennady M. (Graduate Program in Computational and Data Sciences, Keck Center for Science and Engineering, Schmid College of Science and Technology, Chapman University, California, United States) ,  Verkhivker Gennady M. (Department of Biomedical and Pharmaceutical Sciences, Chapman University School of Pharmacy, California, United States)
資料名： Journal of Chemical Theory and Computation  (Journal of Chemical Theory and Computation)
巻： 16  号： 7  ページ： 4706-4725  発行年： 2020年 
JST資料番号： W2328A  ISSN： 1549-9618  CODEN： JCTCCE  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： キナーゼクライアント活性のシャペロンに基づく調節の基礎となる分子原理の理解は,多くの発癌性蛋白質の機能および活性化機構の解明に重要である。最近の実験的研究は,Hsp90とCdc37蛋白質のリン酸化部位がシャペロン調節とキナーゼ相互作用の立体配座通信スイッチとして役立つことを示唆した。しかし,Hsp90におけるリン酸化部位とクライアント結合の間のCdc37の間のアロステリック結合の機構はよく理解されておらず,Hsp90調節におけるリン酸化部位の特異的役割を支える分子シグネチャは未知のままである。本研究では,リン酸化部位のアロステリック効果を定量化し,キナーゼ特異的クライアント結合のコミュニケーションスイッチに特徴的なユニークなシグネチャを同定するために,進化的解析,粗視化分子シミュレーションおよび非結合および結合Hsp90とCdc37構造の走査を組み合わせた。動的コミュニティ間ブリッジネスとコミュニティ中心性に関するネットワークベース計量を用いて,アロステリック調節に関与するリン酸化スイッチの特異的特徴を特性化した。動的残基相互作用ネットワークの摂動に基づく解析により,キナーゼ特異的リン酸化スイッチの変異は長距離効果を誘導し,Hsp90-Cdc37-キナーゼ複合体におけるアロステリックネットワーク及びシグナル伝達の全体的な再配線を誘導することを示した。変異がアロステリック相互作用ネットワークに強い有害な影響を持つHsp90におけるリン酸化部位の特定グループを決定し,リン酸化誘導コミュニケーションスイッチングの機構への洞察を与えた。結果は,Hsp90におけるコミュニケーションのキナーゼ特異的リン酸化スイッチが,既存のアロステリック傾向に基づくそれらの調節役割に対して部分的に素因するかもしれないことを示す。Copyright 2020 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *相互作用 ,  立体配座 ,  *ネットワーク ,  配線 ,  アロステリック効果 ,  *リン酸化 ,  *複合体 ,  通信 ,  *摂動 ,  細胞情報伝達 ,  シャペロンタンパク質
準シソーラス用語： 分子シミュレーション ,  *リン酸化部位 ,  *キナーゼ ,  *残基 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (5件)： 分子構造  (EB03020Y) ,  数値計算  (JE02000J) ,  蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N) ,  計算機シミュレーション  (JE11000H) ,  酵素一般  (EB09010D)

タイトルに関連する用語 (14件)： リン酸化部位 ,  HSP90 ,  Cdc37 ,  調節 ,  複合体 ,  コミュニケーション ,  スイッチング ,  探索 ,  残基 ,  相互作用 ,  摂動 ,  モデリング ,  コミュニティ ,  解析