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J-GLOBAL ID：202002228961583240   整理番号：20A0196109

鉛チャレンジに応答したTypha orientalis根の形態生理学的分析と組み合わせたトランスクリプトーム全体の調節【JST・京大機械翻訳】

Transcriptome -wide modulation combined with morpho-physiological analyses of Typha orientalis roots in response to lead challenge

著者 (11件)： Xu Xiaoying (Key Laboratory of Crop Genetics and Physiology of Jiangsu Province/Key Laboratory of Plant Functional Genomics of the Ministry of Education, College of Bioscience and Biotechnology, Yangzhou University, Yangzhou 225009, China) ,  Xu Xiaoying (Co-Innovation Center for Modern Production Technology of Grain Crops of Jiangsu Province/Joint International Research Laboratory of Agriculture and Agri-Product Safety of the Ministry of Education, Yangzhou University, Yangzhou, 225009, China) ,  Chen Qi (Key Laboratory of Crop Genetics and Physiology of Jiangsu Province/Key Laboratory of Plant Functional Genomics of the Ministry of Education, College of Bioscience and Biotechnology, Yangzhou University, Yangzhou 225009, China) ,  Mo Shuangrong (Key Laboratory of Crop Genetics and Physiology of Jiangsu Province/Key Laboratory of Plant Functional Genomics of the Ministry of Education, College of Bioscience and Biotechnology, Yangzhou University, Yangzhou 225009, China) ,  Qian Ying (Key Laboratory of Crop Genetics and Physiology of Jiangsu Province/Key Laboratory of Plant Functional Genomics of the Ministry of Education, College of Bioscience and Biotechnology, Yangzhou University, Yangzhou 225009, China) ,  Wu Xiaoxia (Key Laboratory of Crop Genetics and Physiology of Jiangsu Province/Key Laboratory of Plant Functional Genomics of the Ministry of Education, College of Bioscience and Biotechnology, Yangzhou University, Yangzhou 225009, China) ,  Wu Xiaoxia (Co-Innovation Center for Modern Production Technology of Grain Crops of Jiangsu Province/Joint International Research Laboratory of Agriculture and Agri-Product Safety of the Ministry of Education, Yangzhou University, Yangzhou, 225009, China) ,  Jin Yingen (Key Laboratory of Crop Genetics and Physiology of Jiangsu Province/Key Laboratory of Plant Functional Genomics of the Ministry of Education, College of Bioscience and Biotechnology, Yangzhou University, Yangzhou 225009, China) ,  Jin Yingen (Co-Innovation Center for Modern Production Technology of Grain Crops of Jiangsu Province/Joint International Research Laboratory of Agriculture and Agri-Product Safety of the Ministry of Education, Yangzhou University, Yangzhou, 225009, China) ,  Ding Haidong (Key Laboratory of Crop Genetics and Physiology of Jiangsu Province/Key Laboratory of Plant Functional Genomics of the Ministry of Education, College of Bioscience and Biotechnology, Yangzhou University, Yangzhou 225009, China) ,  Ding Haidong (Co-Innovation Center for Modern Production Technology of Grain Crops of Jiangsu Province/Joint International Research Laboratory of Agriculture and Agri-Product Safety of the Ministry of Education, Yangzhou University, Yangzhou, 225009, China)
資料名： Journal of Hazardous Materials  (Journal of Hazardous Materials)
巻： 384  ページ： Null  発行年： 2020年 
JST資料番号： B0362A  ISSN： 0304-3894  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 鉛(Pb)は,土壌,水および/または空気を含む多くの環境における一般的汚染物質である。大きな緊急水生植物であるTypha orientalis Preslは,Pb耐性およびPb蓄積植物として機能することが報告されている。しかし,Pbに対するT.orientalisの耐性に関する分子情報はほとんど知られていない。本研究では,Pb蓄積と異なるPb濃度でのPbストレス応答に関与する重要な因子を調べた。Pbは主に根に蓄積し,主に細胞壁と膜系に位置した。RNA-seq分析によるPb曝露後のT.orientalis根において,差次的に発現した遺伝子(DEG)を同定した。0.10mMおよび0.25mMのPb2+処理群において,合計3275のDEGが対照と比較して検出された。これらの遺伝子の多くは酸化還元過程,金属輸送,蛋白質キナーゼ/リン酸化,およびDNA結合転写因子と関連しており,それはPb応答性DEGであることが示された。GenesとGenomes(KEGG)データベース,「フェニルプロパノイド生合成」の京都エンシクロペジアのマッピングを,0.10mMと0.25mMのPb2+処理の重複DEGの重要なモジュールの主要な経路として分析した。さらに,未知の機能を有するToLR1と名付けられた鉛応答遺伝子は,特に興味があった。ToLR1配列の完全長はcDNA末端(RACE)の急速増幅を用いてクローン化され,Arabidopsis thalianaで過剰発現され,Pbストレスに対する抵抗性の増強をもたらした。これはT.orientalisにおけるPb応答遺伝子を詳細に調べるゲノム情報を提供する最初の報告である。さらに,本研究は,Pbストレスに対するT.orientalisおよび他の蓄積者の応答の基礎となる分子機構への新しい洞察を提供する。本研究で同定された重要な遺伝子は,ファイトレメディエーションを標的とする遺伝子工学の潜在的な標的として役立つ可能性がある。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 酸化還元反応 ,  *トランスクリプトーム ,  データベース ,  細胞壁 ,  リン酸化 ,  タンパク質キナーゼ ,  Arabidopsis thaliana ,  *鉛 ,  ファイトレメディエーション ,  クローン ,  生合成 ,  転写因子 ,  汚染物質 ,  遺伝子 ,  cDNA

著者キーワード (6件)： 鉛ストレス ,  RNAシークエンシング ,  RT-QPCR ,  Tolr1 ,  トランスクリプトーム ,  Typha orientalis

分類 (3件)： 鉛とその化合物  (SB05024Q) ,  植物に対する影響  (EE05030G) ,  土壌汚染  (FB04100T)

タイトルに関連する用語 (8件)： 鉛 ,  応答 ,  Typha ,  根の形態 ,  生理学 ,  分析 ,  トランスクリプトーム ,  調節