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J-GLOBAL ID：202002229756732056   整理番号：20A2327799

模擬微小重力下の骨芽細胞様細胞における包括的なサークRNA発現プロファイルと機能ネットワーク【JST・京大機械翻訳】

Comprehensive circRNA expression profile and function network in osteoblast-like cells under simulated microgravity

著者 (6件)： Cao Zhen (College of Biotechnology of Guilin Medical University, Guilin 541199, China) ,  Zhang Yang (Institute of Medical Service and Technology, Academy of Military Science, Tianjin 300161, China) ,  Wei Shuping (Institute of Medical Service and Technology, Academy of Military Science, Tianjin 300161, China) ,  Zhang Xizheng (Institute of Medical Service and Technology, Academy of Military Science, Tianjin 300161, China) ,  Guo Yong (College of Biotechnology of Guilin Medical University, Guilin 541199, China) ,  Han Biao (College of Biotechnology of Guilin Medical University, Guilin 541199, China)
資料名： Gene  (Gene)
巻： 764  ページ： Null  発行年： 2021年 
JST資料番号： E0701B  ISSN： 0378-1119  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 環状RNA(circRNA)は,特別なループスプライシングにより形成される安定な構造をもつ非コードRNAの新しいクラスである。研究は,循環RNAが様々な疾患の病因と進行に不可欠な役割を果たすことを示唆する。しかし,微小重力下の骨芽細胞分化におけるサーコRNAの役割はほとんど不明である。ここでは,模擬微小重力下の骨芽細胞におけるサーコRNAの役割と機械的生物学的応答を検討した。微小重力への曝露時のMC3T3-E1細胞の特異的circRNAとmRNA発現プロファイルを,RNAトランスクリプトーム配列決定技術(RNA-seq)によってスクリーニングした。選択したRNAを,定量的リアルタイムポリメラーゼ連鎖反応(qRT-PCR)を用いて検証した。遺伝子オントロジー(GO)と遺伝子およびゲノム(KEGG)の京都エンシクロペディアを遺伝子機能分析に適用した。対照群(CON)と比較して,模擬微小重力群(SMG)における骨形成分化とともに,合計427のcircRNAと1912のmRNAが差次的に発現した。これらのうち,232のcirRNAと991のmRNAはアップレギュレートされたが,95のcircRNAと921のmRNAは下方制御された(変化≧2,p<0.05)。結果は,サーコRNAとmRNAの親遺伝子が,主に解剖学的構造形態形成,アンカー結合と蛋白質結合に富んでいたことを示した。KEGG分析結果は,差次的に発現したmRNAがアクチン細胞骨格,焦点接着およびRasシグナリング経路の調節に富んでいることを示した。その後,6つのmRNAと3つのサーコRNAを含む9つのコア調節遺伝子を骨芽細胞分化におけるそれらの可能な機能に基づいて同定した。この分析に基づいて,circ_014154を,微小重力下での骨形成分化過程において重要な役割を担っている標的サーコRNAとして選択した。循環RNA-miRNA-mRNAネットワークは,circRNAが骨芽細胞分化を調節するmiRNAスポンジとして作用することを示した。シミュレートした微小重力における遺伝子およびサーコRNAの分子機構のより良い理解を示すことにより,本研究は骨形成分化および骨形成の調節における循環RNAの新しい見解を提供するであろう。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *ネットワーク ,  *RNA【核酸】 ,  mRNA ,  骨形成 ,  形態形成 ,  ダウンレギュレーション ,  *骨芽細胞 ,  *微小重力 ,  病因 ,  Rasタンパク質 ,  トランスクリプトーム
準シソーラス用語： マイクロRNA ,  分子機構 ,  mRNA発現 ,  遺伝子オントロジー , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 模擬微小重力 ,  サーカムRNA ,  骨芽細胞分化 ,  RNA-seq

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  骨格系  (EJ10030R)

タイトルに関連する用語 (6件)： 微小 ,  重力 ,  骨芽細胞様細胞 ,  サーク ,  RNA ,  発現プロファイル