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J-GLOBAL ID：202002229772115219   整理番号：20A0493694

肝細胞癌患者の組織におけるDNAメチル化と遺伝子発現パターンの統合分析【JST・京大機械翻訳】

Integrative Analysis of DNA Methylation and Gene Expression Patterns in Tissues from Hepatocellular Carcinoma Patients

著者 (5件)： Barefoot Megan E. ,  Chen Yifan (Lombardi Comprehensive Cancer Center, Georgetown University Medical Center,Washington, DC) ,  Varghese Rency S. (Lombardi Comprehensive Cancer Center, Georgetown University Medical Center,Washington, DC) ,  Zhou Yuan (Lombardi Comprehensive Cancer Center, Georgetown University Medical Center,Washington, DC) ,  Ressom Habtom W. (Lombardi Comprehensive Cancer Center, Georgetown University Medical Center,Washington, DC)
資料名： IEEE Conference Proceedings  (IEEE Conference Proceedings)
巻： 2019  号： BIBM  ページ： 267-274  発行年： 2019年 
JST資料番号： W2441A  資料種別： 会議録 (C)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 欧州アメリカ人(EAs)と比較して,肝細胞癌(HCC)の発生率はアフリカ系アメリカ人(AAs)で高く,診断と低生存率でより進行した腫瘍ステージと関連している。新生物形質転換におけるDNAメチル化の重要性にもかかわらず,AAsとEAsの間の後成的不一致の機構は,まだHCCにおいて完全に実現されていない。本論文において,著者らは,Illinaメチル化EPIC BeadChipとHiSeq4000プラットフォームを用いて,16人のHCC患者の人種的に多様なコホートにおけるゲノム全体のDNAメチル化と遺伝子発現の統合分析を提示する。混合効果ANOVAモデルを適用して,腫瘍と隣接非癌肝組織の間の分子変化を比較した。腫瘍組成の根底にある変化を制御する努力において,DNAメチル化を用いて腫瘍純度の測定を評価し,細胞混合物効果による潜在的バイアスを説明するための分析を調整した。結果として,著者らは,HCCに関連する17249の差別的メチル化領域(DMRs)と981の差別的メチル化および発現遺伝子(DM+DE)を同定することができた。さらに,14912のDMRsと637のDM+DE遺伝子は,HCCにおけるAAレースと関連すると同定されたEAレースと3,257のDMRsと156のDM+DE遺伝子に関連すると同定された。著者らは,TBX15,IGF1R,WDR66,Itpkb,CFTR,KCNA3,CXCL12,EA特異的MT1L,PIK23R5,およびAA特異的GHRおよびADRA2Bを含むHCCにおける潜在的腫瘍抑制因子として20の候補遺伝子を同定することができた。要約すると,AAおよびEA人種群に特異的なHCCの異なるメチル化および発現マーカーを同定した。これらの知見は,HCC進行における後成的調節の分子機構への洞察を提供し,また,精度治療と診断における人種の不一致に対処する潜在的マーカーを同定する。Copyright 2020 The Institute of Electrical and Electronics Engineers, Inc. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ヨーロッパ ,  ゲノム ,  *メチル化 ,  バイアス ,  分散分析 ,  生存率 ,  純度 ,  *遺伝子 ,  母集団 ,  *肝細胞癌 ,  腫瘍 ,  *遺伝子発現
準シソーラス用語： 候補遺伝子 ,  差別 ,  *DNAメチル化 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  図形・画像処理一般  (JE04010I)

タイトルに関連する用語 (7件)： 肝細胞 ,  癌患者 ,  組織 ,  DNAメチル化 ,  遺伝子発現パターン ,  統合 ,  分析