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J-GLOBAL ID：202002230277148119   整理番号：20A2617212

グラフィックス処理ユニット上でのグローバル配列アラインメントの並列化【JST・京大機械翻訳】

Parallelization of Global Sequence Alignment on Graphics Processing Unit

著者 (5件)： Kalare Kailash W. (PDPM IIITDM,Dept. of Computer Science & Engg.,Jabaplur,India) ,  Obaidat Mohammad S. (College of Computing and Informatics, University of Sharjah,UAE) ,  Tembhurne Jitendra V. (Indian Institute of Information Tech.,Dept. of Computer Science & Engg.,Nagpur,India) ,  Meshram Chandrashekhar (Jayawanti Haksar Government Post Graduation College, College of Chhindwara University,Department of Post Graduation Studies and Research in Mathematics,Betul,M.P,India,460001) ,  Hsiao Kuei-Fang (College of Computing and Informatics, University of Sharjah,Departmnet of Information Systems,UAE)
資料名： IEEE Conference Proceedings  (IEEE Conference Proceedings)
巻： 2020  号： CCCI  ページ： 1-5  発行年： 2020年 
JST資料番号： W2441A  資料種別： 会議録 (C)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本論文では,DNAグローバル配列アラインメント(GSA)を実装するための作業分布戦略を提案した。提案した戦略は,大きな生物学的配列のために,Compute Unified Directorアーキテクチャ(CUDA)に実装される。本研究の主目的は,大きな生物学的配列のDNAグローバルアラインメントに必要な実行時間を最小化することである。提案方法は,メモリ最適化と実行時間の最小化の両方をカバーする。CUDA下の大域的メモリにフィットする異なるサイズの生物学的配列を考察した。グローバルメモリとメモリ最適化の効率的利用は実行時間の結果を支配する。結果は,CUDAを用いた著しく高い高速化を示した。Copyright 2020 The Institute of Electrical and Electronics Engineers, Inc. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *記憶装置 ,  DNA【核酸】 ,  高速化 ,  計算機アーキテクチャ
準シソーラス用語： *配列アライメント ,  実行時間 ,  *GPU【プロセッサ】 ,  CUDA ,  メモリ最適化 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 図形・画像処理一般  (JE04010I)

タイトルに関連する用語 (4件)： グラフィックス処理ユニット ,  グローバル ,  配列アラインメント ,  並列化