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J-GLOBAL ID：202002230329100114   整理番号：20A0451246

ソロモン諸島におけるヤシRhinoceros beetleから分離したOryctes rhinoceros nudivirusの完全ゲノム配列【JST・京大機械翻訳】

Complete genome sequence of Oryctes rhinoceros nudivirus isolated from the coconut rhinoceros beetle in Solomon Islands

著者 (7件)： Etebari Kayvan (School of Biological Sciences, The University of Queensland, Brisbane, Australia) ,  Filipovic Igor (School of Biological Sciences, The University of Queensland, Brisbane, Australia) ,  Filipovic Igor (QIMR Berghofer Medical Research Institute, Royal Brisbane Hospital, Brisbane, Australia) ,  Rasic Gordana (QIMR Berghofer Medical Research Institute, Royal Brisbane Hospital, Brisbane, Australia) ,  Devine Gregor J. (QIMR Berghofer Medical Research Institute, Royal Brisbane Hospital, Brisbane, Australia) ,  Tsatsia Helen (Ministry of Agriculture and Livestock, Honiara, Solomon Islands) ,  Furlong Michael J. (School of Biological Sciences, The University of Queensland, Brisbane, Australia)
資料名： Virus Research  (Virus Research)
巻： 278  ページ： Null  発行年： 2020年 
JST資料番号： A0381D  ISSN： 0168-1702  CODEN： VIREDF  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Oryctes rhinoceros nudivirus(OrNV)は,昆虫害虫Oryctes rhinoceros(甲虫類:コガネムシ科)に対する効果的な生物防除剤であるが,いくつかの宿主個体群において耐性が進化しているという証拠がある。著者らは,Solomon諸島からのO.rhinoceosにおけるOrNV感染を検出し,Oxfordナノ細孔技術(ONT)の長い読み取り配列を用いて,OrNVに耐性として以前に報告されたミトコンドリア系統(CRB-G)に属する個体から分離したウイルスゲノム配列の全長を決定した。ウイルスの完全な円形ゲノムは,マレーシアからのMA07株の独自に記述された完全ゲノム配列よりも125,917ヌクレオチド,1.698bp短い。著者らは139の以前に注釈されたORF(7つの含まれた中断/非コード配列,2つは既存の遺伝子の重複バージョンとして同定された),および4つの遺伝子を含む推定的に逆転した領域を見出した。これらの結果は,新しいウイルス分離株を記述するとき,潜在的な構造変化を解決するための長い読み取り配列技術の有用性を示す。Solomon諸島分離株は最初に記述された株と99.41%のヌクレオチド配列同一性を示したが,多数のアミノ酸挿入および/または欠失を含むコア遺伝子(vlf-1)を含むいくつかの遺伝子を見出した。Solomon諸島における新たに発見された分離株の完全に注釈されたゲノム配列は,ココヤシに対する生物防除剤としてOrNVの有効性を損なう機構を解明するための価値ある資源を提供する。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 虫害 ,  *ゲノム ,  ソロモン諸島 ,  配列相同性 ,  ヌクレオチド ,  生物農薬 ,  コガネムシ科 ,  遺伝子 ,  アミノ酸 ,  ミトコンドリア ,  個体群 ,  有効性 ,  甲虫類 ,  マレーシア
準シソーラス用語： *ゲノム配列 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： Oryctes Rhinoceros Nudivirus(ORNV) ,  ゲノム ,  Oxfordナノポア技術(ONT)シークエンシング ,  Oryctes Rhinoceros ,  コガネムシ科 ,  ヤシRhinoceros甲虫類 ,  ソロモン諸島

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  ウイルスの生化学  (EG04030F)

タイトルに関連する用語 (4件)： 諸島 ,  ヤシ ,  Rhinoceros ,  ゲノム配列