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J-GLOBAL ID：202002230426387300   整理番号：20A2268968

低温EMマップの密度修正【JST・京大機械翻訳】

Density modification of cryo-EM maps

著者 (7件)： Terwilliger Thomas C. (New Mexico Consortium, Los Alamos, NM87544, USA) ,  Terwilliger Thomas C. (Bioscience Division, Los Alamos National Laboratory, Mail Stop M888, Los Alamos, NM87545, USA) ,  Sobolev Oleg V. (Molecular Biophysics and Integrated Bioimaging Division, Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley, CA94720, USA) ,  Afonine Pavel V. (Molecular Biophysics and Integrated Bioimaging Division, Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley, CA94720, USA) ,  Adams Paul D. (Molecular Biophysics and Integrated Bioimaging Division, Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley, CA94720, USA) ,  Adams Paul D. (Department of Bioengineering, University of California Berkeley, Berkeley, California, USA) ,  Read Randy J. (Department of Haematology, University of Cambridge, Cambridge Institute for Medical Research, The Keith Peters Building, Hills Road, CambridgeCB2 0XY, United Kingdom)
資料名： Acta Crystallographica. Section D. Biological Crystallography  (Acta Crystallographica. Section D. Biological Crystallography)
巻： 76  号： 10  ページ： 912-925  発行年： 2020年 
JST資料番号： W0466A  ISSN： 0907-4449  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 密度修正は,平面溶媒のようなマップの特徴に関する期待と,マップを表す個々のFourier項を改善するために,巨大分子の領域における密度の予想される分布を用いる。この過程は,地図の1つの部分から他に情報を転送し,地図の精度を改善できる。ここでは,電子低温顕微鏡からのマップに対する密度修正の背後にある仮定を調べ,モデルベース情報の取り込みを可能にする手順を提示した。密度修正は,高分子と溶媒の間の明確な境界を持つ非濾過,非マスクマップが可視であり,高分子と溶媒の領域の両方で,マップに実質的なノイズが存在する場合に最良に働く。また,マップの特性が高分子と溶媒の領域内で比較的一定であるならば,それは最も効果的であった。モデルベース情報は密度修正を改善するために使用できるが,モデルバイアスは原理的に発生する。ここでは,モデルの不確実性の推定を可能にするアンサンブルモデルを用いてモデルバイアスを低減した。モデルバイアスのテストは,マップの領域における期待密度が不正確なモデルを使用することによって不正確に指定されるとしても,不正確な予想が最終マップにあまり影響しないことを示唆する。Copyright 2020 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 雑音 ,  *低温 ,  電子顕微鏡観察 ,  高分子 ,  バイアス
準シソーラス用語： モデルベース ,  巨大分子 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 低温電子顕微鏡 ,  構造生物学 ,  地図改善 ,  密度修正

分類 (2件)： 生体の顕微鏡観察法  (EA03050C) ,  分子構造  (EB03020Y)

タイトルに関連する用語 (4件)： 低温 ,  EM ,  マップ ,  密度