文献

J-GLOBAL ID：202002230910708537   整理番号：20A1497516

Afghanコムギ生殖質における斑点病抵抗性のゲノムワイド関連研究【JST・京大機械翻訳】

Genome-wide association study for spot blotch resistance in Afghan wheat germplasm

著者 (10件)： Bainsla Naresh K. (Division of Genetics, ICAR-Indian Agricultural Research Institute, New Delhi, India) ,  Phuke Rahul M. (ICAR-Indian Agriculture Research Institute, Indore, India) ,  He Xinyao (International Maize and Wheat Improvement Center (CIMMYT), Texcoco, Mexico) ,  Gupta Vikas (ICAR-Indian Institute of Wheat and Barley Research, Karnal, India) ,  Bishnoi Santosh K. (ICAR-Indian Institute of Wheat and Barley Research, Karnal, India) ,  Sharma Rajiv K. (International Maize and Wheat Improvement Center (CIMMYT), Texcoco, Mexico) ,  Ataei Najibeh (Agricultural Research Institute of Afghanistan (ARIA), Ministry of Agriculture, Irrigation and Livestock (MAIL), Kabul, Afghanistan) ,  Dreisigacker Susanne (International Maize and Wheat Improvement Center (CIMMYT), Texcoco, Mexico) ,  Juliana Philomin (International Maize and Wheat Improvement Center (CIMMYT), Texcoco, Mexico) ,  Singh Pawan K. (International Maize and Wheat Improvement Center (CIMMYT), Texcoco, Mexico)
資料名： Plant Pathology  (Plant Pathology)
巻： 69  号： 6  ページ： 1161-1171  発行年： 2020年 
JST資料番号： B0446B  ISSN： 0032-0862  CODEN： PLPAA  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Bipolaris sorokinianaによって引き起こされるスポットブロット(SB)は,特に南アジアおよび南アメリカにおいて,コムギの壊滅的な病気である。SBに対する耐性の遺伝学を理解することは,耐性を改善する育種戦略の開発に重要である。アフガニスタンからの301の遺伝子型のパネルを,毒性B.sorokiniana分離株の混合物を用いて2つの作物季節にわたって表現型化し,ゲノムワイドマーカーを得るためにDArTSeqを用いて遺伝子型を決定した。50の遺伝子型(16.6%)は,耐性コントロールより少ない疾患スコアを示した。遺伝子型データを用いた主成分分析は遺伝子型を5つの異なる群に分類した。ゲノムワイド関連マッピングに用いたモデルの中で,多遺伝子座混合モデルおよび固定およびランダムモデル循環確率統一アルゴリズムは,有意なマーカー-形質相関(MTA)の同定において最も効果的であった。p≦0.001の25MTAsを染色体1A,1B,1D,2B,2D,3A,3B,4A,5A,5B,6A,7Aおよび7Dで同定し,SBに対する耐性の定量的性質を示した。これらのマーカーにより説明された表現型変異は2.0%から17.7%の範囲であり,染色体1D,2D,3A,3B,4A,5Aおよび5Bのゲノム領域は以前の研究で同定された遺伝子座と一致した。染色体1B(SNP 1113207)と5A(SNP 5411867と998276)の3つの一塩基多型(SNP)マーカーは,両作物季節で,また季節を通しての複合分析でも有意であった。マーカー5411867はVrn-A1に近く,以前の研究でSBと関連することを示した。さらに,既知のSB耐性遺伝子の中で,染色体5B上のSb2は,このパネルにおいて有意であると予測された。Copyright 2020 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アルゴリズム ,  農作物 ,  遺伝子型 ,  染色体 ,  *コムギ ,  表現型 ,  *ゲノム ,  育種 ,  *斑点病 ,  主成分分析 ,  一塩基多型
準シソーラス用語： Bipolaris ,  耐性遺伝子 ,  *生殖質 ,  分離株 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： Afghanコムギ在来種 ,  Bipolaris sorokiniana ,  DArTSeq ,  疾患抵抗性 ,  ゲノムワイド関連研究 ,  Triticum aestivum

分類 (2件)： 菌類による植物病害  (FC04052Y) ,  麦  (FC03033M)

タイトルに関連する用語 (6件)： コムギ ,  生殖質 ,  斑点病 ,  抵抗性 ,  ゲノム ,  研究