文献

J-GLOBAL ID：202002231759805638   整理番号：20A1064477

ウサギにおける内臓前脂肪細胞分化中の長鎖非コードRNAのゲノムワイド同定と特性化【JST・京大機械翻訳】

Genome-wide identification and characterization of long non-coding RNAs during differentiation of visceral preadipocytes in rabbit

著者 (11件)： Du Kun (Farm Animal Genetic Resources Exploration and Innovation Key Laboratory of Sichuan Province, Sichuan Agricultural University, Chengdu, Sichuan, China) ,  Wang Guo-Ze (Farm Animal Genetic Resources Exploration and Innovation Key Laboratory of Sichuan Province, Sichuan Agricultural University, Chengdu, Sichuan, China) ,  Wang Guo-Ze (College of Pharmacy and Biological Engineering, Chengdu University, Chengdu, China) ,  Ren An-yong (Farm Animal Genetic Resources Exploration and Innovation Key Laboratory of Sichuan Province, Sichuan Agricultural University, Chengdu, Sichuan, China) ,  Cai Ming-cheng (Farm Animal Genetic Resources Exploration and Innovation Key Laboratory of Sichuan Province, Sichuan Agricultural University, Chengdu, Sichuan, China) ,  Luo Gang (Farm Animal Genetic Resources Exploration and Innovation Key Laboratory of Sichuan Province, Sichuan Agricultural University, Chengdu, Sichuan, China) ,  Jia Xian-bo (Farm Animal Genetic Resources Exploration and Innovation Key Laboratory of Sichuan Province, Sichuan Agricultural University, Chengdu, Sichuan, China) ,  Hu Shen-qiang (Farm Animal Genetic Resources Exploration and Innovation Key Laboratory of Sichuan Province, Sichuan Agricultural University, Chengdu, Sichuan, China) ,  Wang Jie (Farm Animal Genetic Resources Exploration and Innovation Key Laboratory of Sichuan Province, Sichuan Agricultural University, Chengdu, Sichuan, China) ,  Chen Shi-Yi (Farm Animal Genetic Resources Exploration and Innovation Key Laboratory of Sichuan Province, Sichuan Agricultural University, Chengdu, Sichuan, China) ,  Lai Song-Jia (Farm Animal Genetic Resources Exploration and Innovation Key Laboratory of Sichuan Province, Sichuan Agricultural University, Chengdu, Sichuan, China)
資料名： Functional & Integrative Genomics  (Functional & Integrative Genomics)
巻： 20  号： 3  ページ： 409-419  発行年： 2020年 
JST資料番号： W4378A  ISSN： 1438-7948  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 新しい証拠は,長い非コードRNA(lncRNA)が脂質生成を含む多様な生物学的過程の重要な調節因子であることを示唆する。脂肪生成を研究するための理想的動物モデルと考えられているにもかかわらず,ウサギ前脂肪細胞分化の調節におけるlncRNAの役割についてはほとんど知られていない。本研究では,新生ウサギから分離した内臓前脂肪細胞をin vitroで培養し,分化のために誘導し,分化の0,3および9日目に収集した脂肪細胞の全体的lncRNA発現プロファイルをRNA-seqにより分析した。全部で2066のlncRNAを9つのRNA-seqライブラリーから同定した。蛋白質コード転写物と比較して,lncRNA転写物は長い長さと低い発現レベルの特徴を示した。さらに,3日目から0日目と9日目から3日目にかけて,それぞれ486と357の差次的に発現した(DE)lncRNAが同定された。DE lncRNAの標的遺伝子をcis調節法により予測した。機能の予測により,3日目から0日目を比較したときのDE lncRNAは,発生成長,発生細胞増殖,幹細胞増殖の遺伝子オントロジー(GO)に関与し,PI3K-Aktシグナル伝達経路,脂肪酸生合成,およびインシュリンシグナル伝達経路の遺伝子とゲノム(KEGG)経路に関与していることを明らかにした。9日目と3日目に比較したときのDE lncRNAは,後成的修飾に関連するGO用語に関与し,cAMPシグナル伝達経路のKEGG経路に関与した。本研究はウサギ内臓脂肪におけるlncRNAの調節機能へのさらなる洞察を提供し,前脂肪細胞分化の異なる段階のより良い理解を促進する。Copyright Springer-Verlag GmbH Germany, part of Springer Nature 2019 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *RNA【核酸】 ,  遺伝子 ,  インスリン ,  脂質 ,  *脂肪細胞 ,  細胞増殖 ,  リポゲネシス ,  幹細胞 ,  in vitro実験 ,  内臓脂肪 ,  アデニンヌクレオチド ,  リボヌクレオチド ,  環状ヌクレオチド
準シソーラス用語： 調節因子 ,  標的遺伝子 ,  *脂肪細胞分化 ,  RNA-seq , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： バイオインフォマティクス ,  脂質 ,  ウサギ前脂肪細胞 ,  RNA-seq

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  生物学的機能  (EB04020F)

物質索引 (1件)： cAMP

タイトルに関連する用語 (8件)： ウサギ ,  内臓 ,  前脂肪細胞 ,  分化 ,  長鎖非コードRNA ,  ゲノム ,  同定 ,  特性化