種および亜種レベルにおけるLeuconostoc mesenteroidesの同定のためのrpoB多型およびPCRに基づくアプローチの分析【JST・京大機械翻訳】

Ricciardi Annamaria; Storti Livia V.; Zotta Teresa; Felis Giovanna E.; Parente Eugenio

文献

J-GLOBAL ID：202002231983863160 整理番号：20A0576917

種および亜種レベルにおけるLeuconostoc mesenteroidesの同定のためのrpoB多型およびPCRに基づくアプローチの分析【JST・京大機械翻訳】

Analysis of rpoB polymorphism and PCR-based approaches for the identification of Leuconostoc mesenteroides at the species and subspecies level

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資料名：
巻： 318 ページ： Null 発行年： 2020年
JST資料番号： A0434C ISSN： 0168-1605 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：オランダ (NLD) 言語：英語 (EN)

Leuconostoc mesenteroidesは,亜種cremoris,subsp. dextrranicum,亜種mesenteroidesおよび亜種jonggajibkinchiを含んでいるが,現在の表現型および/または遺伝子型法を用いた亜種レベルでの同定はまだ困難である。本研究において,rpoB遺伝子多型,多重PCR及び表現型試験の解析に基づく多相アプローチを最適化し,種及び亜種レベルにおけるLeuc.mesenteroides株の収集を同定するために用いた。公表されたLeuc.mesenteroidesゲノムの注釈も改訂された。rpoB遺伝子の多形領域はLeuc.mesenteroides株を種(rpoB種特異的PCR)及び亜種(系統発生的比較)レベルで分離するのに有効であった。多重PCRにより,亜種cremorisからの亜種mesenteroidesを識別したが,亜種dextrranicumと亜種jonggajibkiiの間には不確実な属性の株が見られた。ほとんどの表現型特徴は亜種識別に適していなかった。著者らのアッセイは,発酵食品における亜種mesenteroidesおよびsubsp. cremoris株の迅速で信頼できる同定を提供する可能性がある。亜種dextrranicumと亜種jonggajibkiiの識別は,いくつかの限界(例えば,利用可能な菌株とゲノムの低い数,亜種mesenteroidesに近い表現型プロファイル,遺伝子型と表現型形質の間の矛盾)を被り,それらの描写と分類学的位置を明らかにするためにさらなる研究が必要である。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

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