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J-GLOBAL ID：202002233020286541   整理番号：20A1757364

中国の医療能力のある害虫,腹足類軟体動物Philomycus bilineatusの全身のde novoトランスクリプトーム【JST・京大機械翻訳】

De novo transcriptome of the whole-body of the gastropod mollusk Philomycus bilineatus, a pest with medical potential in China

著者 (5件)： Li Zhongjie (Medical College, Henan University of Science and Technology, Luoyang, People’s Republic of China) ,  Yuan Yaping (Medical College, Henan University of Science and Technology, Luoyang, People’s Republic of China) ,  Meng Miaomiao (Medical College, Henan University of Science and Technology, Luoyang, People’s Republic of China) ,  Hu Ping (Medical College, Henan University of Science and Technology, Luoyang, People’s Republic of China) ,  Wang Yong (Medical College, Henan University of Science and Technology, Luoyang, People’s Republic of China)
資料名： Journal of Applied Genetics  (Journal of Applied Genetics)
巻： 61  号： 3  ページ： 439-449  発行年： 2020年 
JST資料番号： A0889A  ISSN： 1234-1983  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Philomycus bilineatusは,中国で非常に一般的な腹足類軟体動物害虫であり,感染症を治療するためにも利用される。しかし,ゲノム資源は,この非モデル種に対して利用できない。本研究では,P.bilineatusのトランスクリプトーム解析を行った。次世代シークエンシング技術を用いた配列決定の後,クリーン読取の9.11Gbを得て,それは145,23の転写産物と125,690のユニジーンの組立とアノテーションに導いた。遺伝子オントロジー(GO),蛋白質(KOG),および遺伝子およびゲノム(KEGG)の京都エンシクロペディアを用いて,単一遺伝子を機能的に分類した。全部で27,554のユニジーンを55のGO用語に割り当てて,13,989のユニジーンを26のKOGカテゴリーに分化し,16,368のユニ遺伝子を229のKEGG経路に割り当てた。さらに,16,614の単純配列反復(SSR),38の嗅覚遺伝子および40の抗菌ペプチド/蛋白質遺伝子を同定した。P.bilineatusのトランスクリプトームプロファイルはさらなる研究のための貴重なゲノム資源を提供し,化学感覚コミュニケーションの干渉による新しい害虫管理戦略の開発を促進し,この種の潜在的薬用使用を支援するであろう。Copyright Institute of Plant Genetics, Polish Academy of Sciences, Poznan 2020 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 嗅覚 ,  *害虫 ,  RNA【核酸】 ,  遺伝子 ,  タンパク質 ,  *軟体動物 ,  ゲノム ,  感染症 ,  アノテーション ,  *トランスクリプトーム
準シソーラス用語： トランスクリプトーム解析 ,  抗菌ペプチド ,  遺伝子オントロジー ,  KEGG ,  次世代シークエンシング , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Philomycus bilineatus ,  トランスクリプトーム ,  RNA配列決定嗅覚遺伝子 ,  抗菌ペプチド/蛋白質遺伝子

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (8件)： 中国 ,  医療 ,  能力 ,  害虫 ,  腹足類 ,  軟体動物 ,  全身 ,  トランスクリプトーム