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J-GLOBAL ID：202002233116873056   整理番号：20A2349210

グローバルトランスクリプトームおよび相関分析はCamellia oleifera Abelにおける果実発育および脂肪酸決定に関連する品種特異的分子シグネチャを明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Global Transcriptome and Correlation Analysis Reveal Cultivar-Specific Molecular Signatures Associated with Fruit Development and Fatty Acid Determination in Camellia oleifera Abel

著者 (12件)： Peng Shaofeng (Beijing Forestry University, Haidian, 100083 Beijing, China) ,  Peng Shaofeng (Hunan Academy of Forestry, Changsha, 410004 Hunan, China) ,  Peng Shaofeng (National Engineering Research Center for Oil-Tea Camellia, Changsha, 410004 Hunan, China) ,  Lu Jia (Central South University of Forestry and Technology, Changsha, 410004 Hunan, China) ,  Zhang Zhen (Hunan Academy of Forestry, Changsha, 410004 Hunan, China) ,  Zhang Zhen (National Engineering Research Center for Oil-Tea Camellia, Changsha, 410004 Hunan, China) ,  Ma Li (Hunan Academy of Forestry, Changsha, 410004 Hunan, China) ,  Ma Li (National Engineering Research Center for Oil-Tea Camellia, Changsha, 410004 Hunan, China) ,  Liu Caixia (Hunan Academy of Forestry, Changsha, 410004 Hunan, China) ,  Liu Caixia (National Engineering Research Center for Oil-Tea Camellia, Changsha, 410004 Hunan, China) ,  Chen Yongzhong (Hunan Academy of Forestry, Changsha, 410004 Hunan, China) ,  Chen Yongzhong (National Engineering Research Center for Oil-Tea Camellia, Changsha, 410004 Hunan, China)
資料名： International Journal of Genomics (Web)  (International Journal of Genomics (Web))
巻： 2020  ページ： Null  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7732A  ISSN： 2314-436X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景.油茶Camelliaは中国南部に広く分布する非常に重要な食用油脂植物である。油茶Camellia種子から抽出した茶油は健康に有益であり,健康食用油と考えられている。油-茶Camellia種子カーネルにおける脂肪酸生合成に関連する遺伝子を同定し,異なる発育段階における種子カーネルの包括的なトランスクリプトーム分析を行い,果実の最適採取時間を調べた。材料と方法:ガスクロマトグラフィー-質量分析計を用いて,試料中の種々の脂肪酸の含有量を検出した。トランスクリプトーム分析を行い,遺伝子動態と対応する機能を検出した。結果.油含有量,オレイン酸含有量,リノール酸含有量,リノレン酸含量,果実重量,果実高さ,果実直径,単一種子重量,種子長さ,種子幅,種子長,および種子幅を含む多重表現型データを詳細に計数し,多くの指標が油茶Camelliaの発達とともに増加することを示した。トランスクリプトミクスは,異なる発達段階のための動的遺伝子発現ネットワークに関する包括的でシステムレベルの見解を実行するために行われた。XL106(6つの時点)とXL210(8つの時点)の短い時系列発現Miner(STEM)分析を関連脂肪酸(FA)遺伝子セットをスクリーニングするために行い,それからFAに関連する1041の候補遺伝子をXL106で選択し,202関連遺伝子をGOとKEGG濃縮に基づいてXL210でスクリーニングした。次に,候補遺伝子と形質データセットを相関解析を行うために組み合わせ,そして,10の遺伝子をいくつかの重要な形質と強く接続した。結論.多重表現型データは,採取段階における変化の動的法則を明らかにした。トランスクリプトーム解析は,乾燥穀粒,オレイン酸,リノール酸,リノレン酸,新鮮種子率,および穀粒対種子比の油含有量を制御することができる多数の潜在的鍵調節因子を同定し,それによって,油茶Camelliaの採取段階の基礎となる分子ネットワークへの新しい洞察を提供し,最適果実採取点の理論的基礎を提供する。Copyright 2020 Shaofeng Peng et al. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ネットワーク ,  ガスクロマトグラフィー ,  *脂肪酸 ,  遺伝子 ,  表現型 ,  *品種 ,  *果実【器官】 ,  成長段階 ,  遺伝子発現 ,  *ツバキ属 ,  *トランスクリプトーム ,  不飽和脂肪酸 ,  オレフィン化合物 ,  ジエン ,  ポリエン ,  ω-3脂肪酸
準シソーラス用語： 候補遺伝子 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 物質の代謝  (EH02050Q) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

物質索引 (3件)： オレイン酸 ,  リノール酸 ,  リノレン酸

引用文献 (34件)：

• J.-L. Feng, Z. J. Yang, S. P. Chen, Y. A. el-Kassaby, H. Chen, "High throughput sequencing of small RNAs reveals dynamic microRNAs expression of lipid metabolism during Camellia oleifera and C. meiocarpa seed natural drying," BMC Genomics, vol. 18, no. 1, pp. 546, 2017.
• Y. T. Cheng, C. C. Lu, G. C. Yen, "Beneficial effects of Camellia oil (Camellia oleifera Abel.) on hepatoprotective and gastroprotective activities," Journal of Nutritional Science and Vitaminology, vol. 61, pp. S100-S102, 2015.
• P. Lin, K. Wang, C. Zhou, Y. Xie, X. Yao, H. Yin, "Seed transcriptomics analysis in Camellia oleifera uncovers genes associated with oil content and fatty acid composition," International Journal of Molecular Sciences, vol. 19, no. 1, 2018.
• C. Yang, X. Liu, Z. Chen, Y. Lin, S. Wang, "Comparison of oil content and fatty acid profile of ten new Camellia oleifera cultivars," Journal of Lipids, vol. 2016, pp. 6, 2016.
• H. Liu, J. Gu, Q. Lu, H. Li, Y. Hong, X. Chen, L. Ren, L. Deng, X. Liang, "Transcriptomic analysis reveals the high-oleic acid feedback regulating the homologous gene expression of stearoyl-ACP desaturase 2 (SAD2) in peanuts," International Journal of Molecular Sciences, vol. 20, no. 12, pp. 3091, 2019.

タイトルに関連する用語 (10件)： グローバル ,  トランスクリプトーム ,  相関分析 ,  Camellia ,  果実 ,  発育 ,  脂肪酸 ,  品種 ,  分子 ,  シグネチャ