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J-GLOBAL ID：202002233159158605   整理番号：20A0337844

純粋なPOPCとPOPC/CHOL二分子層を通る脂質移動の自由エネルギープロファイル:全原子分子動力学研究【JST・京大機械翻訳】

Free energy profiles of lipid translocation across pure POPC and POPC/CHOL bilayer: all-atom molecular dynamics study

著者 (6件)： Saito Hiroaki (RIKEN Center for Biosystems Dynamics Research (BDR), Suita, Japan) ,  Morishita Tetsuya (CD-FMat, and MathAM-OIL, National Institute of Advanced Industrial Science and Technology (AIST), Tsukuba, Japan) ,  Mizukami Taku (Japan Advanced Institute of Science and Technology (JAIST), Nomi, Japan) ,  Nishiyama Ken-ichi (Cryobiofrontier Research Center, Faculty of Agriculture, Iwate University, Morioka, Japan) ,  Kawaguchi Kazutomo (Institute of Science and Engineering Kanazawa University, Kanazawa, Japan) ,  Nagao Hidemi (Institute of Science and Engineering Kanazawa University, Kanazawa, Japan)
資料名： Journal of Physics: Conference Series  (Journal of Physics: Conference Series)
巻： 1290  号： 1  ページ： 012020 (8pp)  発行年： 2019年 
JST資料番号： W5565A  ISSN： 1742-6588  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： CHARMM36力場による純粋な1-パルミトイル-2-オレオイル-sn-グリセロ-3-ホスホコリン(POPC)二分子層とコレステロール(POPC/CHOL)を含むPOPC二分子層の全原子分子動力学(MD)シミュレーションを行い,膜を横切る構造と脂質転移に及ぼすCHOLの影響を調べた。純粋なPOPCに沿ったPOPCとCHOLの移動に対するポテンシャル平均力(PMF)プロファイルを計算した。得られたPOPC転位のPMFプロフィルは以前のMD研究のそれと良く一致し,CHARMM36力場による推定PMFプロフィルが合理的であることを示した。PMFピークは二層中心を超えてわずかに現れることを見出した。POPC転座のPMFプロファイルに及ぼすCHOL効果を明確に観察した。脂質のフリップフロップに対する自由エネルギー障壁は増加し,脂質の脱着に対するエネルギーは減少した。PMFプロファイルにおけるこれらの変化はPOPC/CHOL二分子層の密充填の原因である。CHOL転位に対するPMFプロフィルは,二分子層中心における自由エネルギー障壁がPOPC転位のそれらよりも十分小さく,CHOLが膜中のPOPCと比較して容易にフリップできることを示した。POPC/CHOLシステムにおけるCHOL転位のPMFの場合,疎水性コア領域におけるPMFエネルギーは純粋なPOPC二分子層のそれより高かったが,二分子層中心における自由エネルギー差は小さかった。Please refer to the publisher for the copyright holders. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 双安定回路 ,  *分子動力学 ,  疎水性 ,  *自由エネルギー ,  シミュレーション ,  転座 ,  力の場 ,  *脂質 ,  *二分子層 ,  コア領域 ,  二層 ,  細胞遺伝現象

分類 (2件)： 生体膜一般  (EF04010G) ,  脂質一般  (EB05010B)

タイトルに関連する用語 (8件)： POPC ,  二分子層 ,  脂質 ,  自由エネルギー ,  プロファイル ,  原子分子 ,  動力学 ,  研究