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J-GLOBAL ID：202002233398952385   整理番号：20A2518424

結晶エネルギー景観の系統的有限温度還元【JST・京大機械翻訳】

Systematic Finite-Temperature Reduction of Crystal Energy Landscapes

著者 (6件)： Francia Nicholas F. (Thomas Young Centre and Department of Chemical Engineering, University College London, U.K.) ,  Price Louise S. (Department of Chemistry, University College London, U.K.) ,  Nyman Jonas (Small Molecule Design & Development, Eli Lilly and Company, Indiana, United States) ,  Nyman Jonas (Holly Chemistry, Sweden) ,  Price Sarah L. (Department of Chemistry, University College London, U.K.) ,  Salvalaglio Matteo (Thomas Young Centre and Department of Chemical Engineering, University College London, U.K.)
資料名： Crystal Growth & Design  (Crystal Growth & Design)
巻： 20  号： 10  ページ： 6847-6862  発行年： 2020年 
JST資料番号： W1323A  ISSN： 1528-7483  CODEN： CGDEFU  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 結晶構造予測法は有機分子のポテンシャル多形の数を過大評価する傾向がある。本研究では,有限温度と圧力で容易に相互変換できる構造のサブセットをクラスター化するために,分子動力学シミュレーションとバイアスサンプリング法を系統的に適用することにより,過大予測を低減することを目的とした。このアプローチに続いて,結晶構造予測(CSP)生成結晶エネルギー景観における予測推定多形の数を合理的に低減した。これは,独立有限温度分子動力学軌跡を解析するために教師なしクラスタリング手法を使用し,従って,有限温度と圧力で効果的に等価である異なる格子エネルギー極小の各クラスタの代表的構造を同定した。制限サンプリング時間の影響を低減し,多形変換に関連する仕事を推定するために,バイアスシミュレーションを用いた。尿素とコハク酸の多形を研究して,実験的に知られている多形を含む12と27にそれぞれ100以上のエネルギー的に妥当なCSP構造の初期セットを還元して,提案した系統的アプローチを示した。また,シミュレーションは,実際の構造で起こるかもしれない無秩序と積層誤差のタイプを示した。Copyright 2020 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 予測技法 ,  結晶構造 ,  シミュレーション ,  格子エネルギー ,  クラスタ化 ,  相互変換 ,  有機化合物 ,  *クラスタ ,  バイアス ,  分子動力学 ,  ウレア化合物 ,  脂肪族カルボン酸 ,  ジカルボン酸
準シソーラス用語： 分子動力学シミュレーション ,  *有限温度 ,  教師なしクラスタリング , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 物理薬剤学  (GY01012A) ,  芳香族化合物の結晶構造  (BK08020F)

物質索引 (2件)： 尿素 ,  コハク酸

タイトルに関連する用語 (6件)： 結晶 ,  エネルギー ,  景観 ,  系統 ,  有限温度 ,  還元