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J-GLOBAL ID：202002233792020411   整理番号：20A2210218

クローン相関からの系統再構成【JST・京大機械翻訳】

Lineage reconstruction from clonal correlations

著者 (2件)： Weinreb Caleb (Department of Systems Biology, Harvard Medical School, Boston, MA 02115) ,  Klein Allon M. (Department of Systems Biology, Harvard Medical School, Boston, MA 02115)
資料名： Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  (Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America)
巻： 117  号： 29  ページ： 17041-17048  発行年： 2020年 
JST資料番号： D0387A  ISSN： 0027-8424  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 発生生物学における中心的課題は,組織または生物において各成熟細胞タイプを導く運命決定の配列を学ぶことである。最近,DNAバーコードを用いた細胞のクローン標識は,運命決定の一般的な祖先を共有する細胞を同定するための強力なアプローチとして浮上している。ここでは,組織発達中の細胞運命選択の確率的性がクローンバーコーディングの一段階後に系統関係を読み出すために利用できるという考えを探求した。一般化マルチタイプ分岐過程を考慮することにより,観察された細胞型上のバーコードの最終分布がそれらのbona fide系統関係をコードする条件を決定した。次に,運命決定の次数を推論するための方法を提案した。著者らの理論は,この方法の有効性の一貫性チェックとして役立つバーコード共分散の対称性の集合を予測する。壊れた対称性は,同じ細胞型への分化の複数の経路を検出するために使用できることを示した。一般的使用のための計算ツールを提供した。造血におけるバーコーディングデータに適用した場合,これらのツールは,古典的造血階層を再構築し,単球と樹状細胞の間の結合を検出し,これらの系統に対する分化の複数の経路を示唆する赤血球と好塩基球との間の結合を検出する。Copyright 2020 The Author(s). Published by PNAS. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 対称性 ,  赤血球 ,  共分散 ,  造血 ,  再構成 ,  分枝過程 ,  *クローン ,  バーコード ,  有効性 ,  樹状細胞 ,  単球 ,  好塩基球
準シソーラス用語： 系統関係 ,  細胞運命 ,  バーコーディング , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (3件)： クローンバーコード ,  分岐過程 ,  系統追跡

分類 (5件)： 発生と分化  (EJ16020W) ,  細胞分裂・増殖  (EF02020D) ,  細胞生理一般  (EF02010S) ,  生物学的機能  (EB03040U) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (4件)： クローン ,  相関 ,  系統 ,  再構成