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J-GLOBAL ID：202002234407748907   整理番号：20A0626617

Arabidopsis thaliana由来の葉緑体グルタミンホスホリボシルピロりん酸アミドトランスフェラーゼGPRAT2の結晶構造【JST・京大機械翻訳】

Crystal Structure of the Chloroplastic Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate Amidotransferase GPRAT2 From Arabidopsis thaliana

著者 (9件)： Cao Xueli (Beijing Advanced Innovation Center for Soft Matter Science and Engineering, Beijing Key Laboratory of Bioprocess, Beijing University of Chemical Technology, Beijing, China) ,  Du Bowen (Beijing Advanced Innovation Center for Soft Matter Science and Engineering, Beijing Key Laboratory of Bioprocess, Beijing University of Chemical Technology, Beijing, China) ,  Han Fengjiao (Beijing Advanced Innovation Center for Soft Matter Science and Engineering, Beijing Key Laboratory of Bioprocess, Beijing University of Chemical Technology, Beijing, China) ,  Zhou Yu (Department of Computational Chemistry, National Institute of Biological Sciences, Beijing, China) ,  Ren Junhui (Beijing Advanced Innovation Center for Soft Matter Science and Engineering, Beijing Key Laboratory of Bioprocess, Beijing University of Chemical Technology, Beijing, China) ,  Wang Wenhe (Beijing Advanced Innovation Center for Soft Matter Science and Engineering, Beijing Key Laboratory of Bioprocess, Beijing University of Chemical Technology, Beijing, China) ,  Chen Zeliang (Beijing Advanced Innovation Center for Soft Matter Science and Engineering, Beijing Key Laboratory of Bioprocess, Beijing University of Chemical Technology, Beijing, China) ,  Chen Zeliang (Key Laboratory of Livestock Infectious Diseases in Northeast China, Ministry of Education, College of Animal Science and Veterinary Medicine, Shenyang Agricultural University, Shenyang, China) ,  Zhang Yi (Beijing Advanced Innovation Center for Soft Matter Science and Engineering, Beijing Key Laboratory of Bioprocess, Beijing University of Chemical Technology, Beijing, China)
資料名： Frontiers in Plant Science (Web)  (Frontiers in Plant Science (Web))
巻： 11  ページ： 157  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7094A  ISSN： 1664-462X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： クロロ塑性リンホスホリボシルピロりん酸アミドトランスフェラーゼ(GPRATase)はArabidopsis thalianaにおけるde novoプリン生合成の最初のコミット段階を触媒し,DAS734はAtGRATの直接的で特異的な阻害剤であり,既知AtGPRAT遺伝子変異体,特にcia1とatd2の葉のベチング表現型に類似した植物毒性効果を有する。しかしながら,AtGPRATの構造とDAS734の阻害様式は,まだ十分に理解されていない。本研究では,AtGPRAT2と細菌酵素の間の構造的差異を明らかにしたAtGPRAT2の構造を解明した。速度論分析は,DAS734がAtGPAT2の基質ホスホリボシルピロりん酸(PRPP)に対する競合阻害剤として挙動することを示した。ドッキング研究により,DAS734はR264との静電相互作用及びいくつかの残基との疎水性相互作用を形成し,結合アッセイにより検証された。まとめると,著者らの研究は,Arabidopsis GPRアーゼを標的とするより強力な除草剤のさらなる開発への将来の研究に対する,AtGPAT2へのDAS734の阻害機構への重要な洞察を提供する。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *Arabidopsis thaliana ,  触媒 ,  基質 ,  遺伝子変異 ,  *Arabidopsis ,  表現型 ,  ドッキング ,  *結晶構造 ,  除草剤 ,  細菌 ,  *トランスフェラーゼ ,  静電相互作用 ,  生合成 ,  塑性 ,  *リン酸

著者キーワード (6件)： 葉緑体グルタミンホスホリボシルピロりん酸アミドトランスフェラーゼ ,  除草剤 ,  X線結晶学 ,  競合的阻害 ,  Arabidopsis thaliana ,  DAS734

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (35件)：

• Adams P. D., Grosse-Kunstleve R. W., Hung L. W., Ioerger T. R., McCoy A. J., Moriarty N. W., et al. (2002). PHENIX: building new software for automated crystallographic structure determination. Acta Crystallogr. D Biol. Crystallogr. 58, 1948-1954. doi: doi: 10.1107/S0907444902016657
• Banks J. L., Beard H. S., Cao Y. X., Cho A. E., Damm W., Farid R., et al. (2005). Integrated modeling program, applied chemical theory (IMPACT). J. Comput. Chem. 26, 1752-1780. doi: doi: 10.1002/jcc.20292
• Bera A. K., Smith J. L., Zalkin H. (2000). Dual role for the glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase ammonia channel. Interdomain signaling and intermediate channeling. J. Biol. Chem. 275, 7975-7979. doi: doi: 10.1074/jbc.275.11.7975
• Boldt R., Zrenner R. (2003). Purine and pyrimidine biosynthesis in higher plants. Physiol. Plant 117, 297-304. doi: doi: 10.1034/j.1399-3054.2003.00030.x
• Chen S., Tomchick D. R., Wolle D., Hu P., Smith J. L., Switzer R. L., et al. (1997). Mechanism of the synergistic end-product regulation of Bacillus subtilis glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase by nucleotides. Biochemistry 36, 10718-10726. doi: doi: 10.1021/bi9711893

タイトルに関連する用語 (5件)： Arabidopsis ,  葉緑体 ,  グルタミン ,  ホスホリボシルピロりん酸 ,  結晶構造