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J-GLOBAL ID：202002234739316611   整理番号：20A2634210

PCRベースドットクロマトグラフィーストリップを用いたKarlodinium veneficumの簡易検出【JST・京大機械翻訳】

Easy detection of karlodinium veneficum using PCR-based dot chromatography strip

著者 (7件)： Chen Qixin (College of Oceanology, Harbin Institute of Technology (Weihai), Weihai 264209, China) ,  Zhang Chunyun (College of Oceanology, Harbin Institute of Technology (Weihai), Weihai 264209, China) ,  Zhang Chunyun (School of Marine Sciences, Ningbo University, Ningbo, 315211, China) ,  Liu Fuguo (College of Oceanology, Harbin Institute of Technology (Weihai), Weihai 264209, China) ,  Ma Hengyuan (College of Oceanology, Harbin Institute of Technology (Weihai), Weihai 264209, China) ,  Wang Yuanyuan (College of Oceanology, Harbin Institute of Technology (Weihai), Weihai 264209, China) ,  Chen Guofu (College of Oceanology, Harbin Institute of Technology (Weihai), Weihai 264209, China)
資料名： Harmful Algae  (Harmful Algae)
巻： 99  ページ： Null  発行年： 2020年 
JST資料番号： W2138A  ISSN： 1568-9883  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本研究では,PCRに基づくドットクロマトグラフィーストリップ(PDCS)による新規検出法を提案した。有害な微細藻類の検出におけるPDCSの適用を調べるために,最も一般的なブルーム形成種の1つであるKarlodinium veneficumの内部転写スペーサー配列をクローン化し,配列し,金ナノ粒子プローブ,試験プローブ,および対照プローブを含むタグ配列およびプローブを有する特異的プライマーを設計し,スクリーニングした。PDCSを手動で調製し,標識特異的プライマーを用いてK.veneficumのゲノムDNAから調製したPCRアンプリコンを,標的種の視覚検出のためのPDCSによって分析した。得られたテストストリップは,予測テストで赤点を示し,裸眼に見える対照点を示し,PDCSの成功裏の発達を示した。この検出技術は高価な実験装置(PCRのためのDNA熱サイクル器を除く)には依存しないが,分析結果を可視化するために約10分間PDCSの試料パッドに適用するために開発緩衝液と混合したPCRアンプリコンの分割を必要とする。K.veneficumを含む21の微細藻類による交差反応性試験は,確立したPDCS技術が優れた特異性を有することを示した。PDCSの検出限界はゲノムDNAに対して9.13×10-2ngμL-1,標的藻類の粗DNA抽出物に対して5.3×105細胞L-1であった。要約すると,高感度と特異性を有するPDCSは手で調製でき,従来のストリップよりも安価であり,天然試料中のK.veneficumの検出の有望な代替法を提供する。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 視覚 ,  熱サイクル ,  *クロマトグラフィー ,  DNA【核酸】 ,  可視化 ,  検出法 ,  クローン ,  検出限界
準シソーラス用語： アンプリコン ,  微小藻類 ,  ゲノムDNA ,  DNA抽出 ,  低価格 ,  金ナノ粒子 ,  裸眼 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Karlodinium veneficum ,  Pcr ,  ドットクロマトグラフィーストリップ ,  検出

分類 (2件)： 微生物検査法  (EG02020G) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

タイトルに関連する用語 (3件)： PCR ,  Karlodinium ,  簡易