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J-GLOBAL ID：202002234763744292   整理番号：20A2004914

構造決定因子としてループ構造を用いた細胞G四重鎖の検出【JST・京大機械翻訳】

Detection of cellular G-quadruplex by using a loop structure as a structural determinant

著者 (4件)： Masai Hisao (Department of Basic Medical Sciences, Tokyo Metropolitan Institute of Medical Science, Kamikitazawa, Setagaya-ku, Tokyo, 156-8506, Japan) ,  Kanoh Yutaka (Department of Basic Medical Sciences, Tokyo Metropolitan Institute of Medical Science, Kamikitazawa, Setagaya-ku, Tokyo, 156-8506, Japan) ,  Kakusho Naoko (Department of Basic Medical Sciences, Tokyo Metropolitan Institute of Medical Science, Kamikitazawa, Setagaya-ku, Tokyo, 156-8506, Japan) ,  Fukatsu Rino (Department of Basic Medical Sciences, Tokyo Metropolitan Institute of Medical Science, Kamikitazawa, Setagaya-ku, Tokyo, 156-8506, Japan)
資料名： Biochemical and Biophysical Research Communications  (Biochemical and Biophysical Research Communications)
巻： 531  号： 1  ページ： 75-83  発行年： 2020年 
JST資料番号： B0118A  ISSN： 0006-291X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： G-quadrupexは,現在,様々な生物学的反応において重要な役割を果たすことが知られている。しかし,細胞中のその存在に対する直接的な証拠は,多目的で非バイアスな方法論の欠如のため,限られている。分裂酵母ゲノム上のRif1結合部位を用い,Rif1 BSが実際にG4構造を採用することを証明するモデルとしてG4構造を採用することが示されている。G4構造における一本鎖ループの存在を利用した。Rif1BSは異常に長いループ配列を含み,それらを18bp I-SceI制限部位と置換した。ループにおけるI-SceIはG4が二本鎖Rif1BS DNA上に形成されると切断されないが,G4がG-tractの突然変異により形成されないときに切断されることを示した。これは熱誘導および転写誘導G4構造の両方が観察され,この手順の証拠の証明を与える。この戦略を,分裂酵母細胞における同じRif1BSでのG4構造の検出に適用した。I-SceIのin vivo切断は,細胞中の標的配列におけるG4の存在の尺度である証拠を示した。ここで述べた方法は,細胞G4のゲノムワイド分析とそれらの動的形成と破壊のためのプラットフォーム戦略を与える。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： DNA【核酸】 ,  RNA【核酸】 ,  突然変異 ,  ゲノム ,  結合部位 ,  バイアス ,  *重鎖 ,  Schizosaccharomyces ,  *ループ構造
準シソーラス用語： 決定因子 ,  *G-四重鎖 ,  I-SceI ,  Rif1蛋白質 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： G-四重鎖 ,  Rif1 ,  制限消化 ,  ループ ,  RNA-DNAハイブリッド ,  G4のin vivo検出

分類 (3件)： 細胞構成体一般  (EF03010Z) ,  遺伝子発現  (EC02040Q) ,  細胞構成体の機能  (EF03060C)

タイトルに関連する用語 (4件)： 決定因子 ,  ループ構造 ,  細胞 ,  G四重鎖