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J-GLOBAL ID：202002235257069434   整理番号：20A1013281

カブトガニTachypleus tridentatusのドラフトゲノムはその進化シナリオと十分に発達した自然免疫を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

The draft genome of horseshoe crab Tachypleus tridentatus reveals its evolutionary scenario and well-developed innate immunity

著者 (12件)： Zhou Yan (State Key Laboratory of Genetic Engineering, School of Life Sciences, Fudan University, Shanghai, China) ,  Zhou Yan (Shanghai-MOST Key Laboratory of Health and Disease Genomics, Chinese National Human Genome Center at Shanghai, Shanghai, China) ,  Liang Yuan (State Key Laboratory of Genetic Engineering, School of Life Sciences, Fudan University, Shanghai, China) ,  Yan Qing (Shanghai-MOST Key Laboratory of Health and Disease Genomics, Chinese National Human Genome Center at Shanghai, Shanghai, China) ,  Zhang Liang (Shanghai-MOST Key Laboratory of Health and Disease Genomics, Chinese National Human Genome Center at Shanghai, Shanghai, China) ,  Chen Dianbao (Institute of Oceanography, Minjiang University, Fuzhou, China) ,  Ruan Lingwei (State Key Laboratory Breeding Base of Marine Genetic Resources, Fujian Collaborative Innovation Center for Exploitation and Utilization of Marine Biological Resources, Third Institute of Oceanography, Ministry of Natural Resources, Xiamen, China) ,  Kong Yuan (Institute of Oceanography, Minjiang University, Fuzhou, China) ,  Shi Hong (State Key Laboratory Breeding Base of Marine Genetic Resources, Fujian Collaborative Innovation Center for Exploitation and Utilization of Marine Biological Resources, Third Institute of Oceanography, Ministry of Natural Resources, Xiamen, China) ,  Chen Mingliang (State Key Laboratory Breeding Base of Marine Genetic Resources, Fujian Collaborative Innovation Center for Exploitation and Utilization of Marine Biological Resources, Third Institute of Oceanography, Ministry of Natural Resources, Xiamen, China) ,  Chen Jianming (Institute of Oceanography, Minjiang University, Fuzhou, China) ,  Chen Jianming (Sino-French Hoffmann Institute, School of Basic Medical Sciences, Guangzhou Medical University, Guangzhou, China)
資料名： BMC Genomics (Web)  (BMC Genomics (Web))
巻： 21  号： 1  ページ： 1-15  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7048A  ISSN： 1471-2164  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 馬蹄カニは古代の海洋節足動物で,長い進化史を持ち,それらの自然免疫系から利益を得る可能性がある。しかし,侵入微生物に対する識別と防御の能力の基礎となる遺伝的機構はまだ不明である。ここでは,24 222の予測蛋白質コード遺伝子を有するTachypleus tridentatusの2.06 Gbpゲノム集合について述べる。比較ゲノミクスにより,T.tridentatusと大西洋馬蹄カニLimulus polyphemusは,免疫関連JAK-STATシグナル伝達経路に関与する遺伝子を含む2つの種間で共有される最もオーソログがあることを示した。発散時間年代測定の結果は,アジアの馬蹄カニ(T.tridentatusとC.rotundicaudaを含む)とL.polyphemusの最後の共通祖先が約130Mya(121-141)を示し,2つのアジアの馬蹄カニの分裂は約63Mya(57-69)であることを示した。Hox遺伝子解析は,両方の馬蹄カニ集合における2つのクラスターを示唆する。驚くべきことに,免疫関連遺伝子ファミリーの選択的分析は,保存されたパターン認識受容体の高い拡大を明らかにした。IMD及びJAK-STATシグナル伝達経路に関与する遺伝子は,両ゲノムにおいてある程度の拡大を示した。無傷の凝固カスケード関連遺伝子は,より多くの凝固因子遺伝子を有するT.tridentatusゲノムに存在した。さらに,ほとんどの報告された抗菌ペプチドは,それらの潜在的に有効な抗菌部位を有するT.tridentatusにおいて同定されている。T.tridentatusのドラフトゲノムは,Chelicerataの分類学的および進化的関係をさらに明らかにするための重要な証拠を提供する。T.tridentatusにおける保存された免疫シグナル伝達経路遺伝子,凝固因子および無傷抗菌ペプチドの拡大は,膨大な数の侵入病原体を持つ海洋環境における自己防御のためのロバストで効果的な自然免疫を構成し,複雑な海洋環境に関する適応特性の質に影響する可能性がある。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 凝固 ,  微生物 ,  海洋環境 ,  遺伝 ,  遺伝子 ,  海洋 ,  年代測定 ,  *ゲノム ,  クラスタ ,  病原体 ,  ロバスト性 ,  ホメオボックス遺伝子 ,  *自然免疫
準シソーラス用語： オルソログ ,  抗菌ペプチド , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Tachypleus Tridentatus ,  ゲノム ,  進化 ,  自然免疫 ,  凝固

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  進化論一般  (EC03010Q)

引用文献 (96件)：

• Palaeontology; The oldest horseshoe crab: a new xiphosurid from late Ordovician Konservat-Lagerstätten deposits, Manitoba, Canada; DM Rudkin, GA Young, GS Nowlan; 51; 2008; 1-9; 10.1111/j.1475-4983.2007.00746.x; citation_id=CR1
• The Xiphosurida: archetypes of bradytely?; Living fossils; 1984; 196-213; CR2; DC Fisher; citation_publisher=Springer
• Biology of horseshoe crabs; 1988; CR3; K Sekiguchi; citation_publisher=International Specialized Book Service Incorporated
• Journal of Biochemistry; New Types of Clotting Factors and Defense Molecules Found in Horseshoe Crab Hemolymph: Their Structures and Functions; S. Iwanaga, S.-i. Kawabata, T. Muta; 123; 1; 1998; 1-15; 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a021894; citation_id=CR4
• The FASEB Journal; High-affinity LPS binding domain(s) in recombinant factor C of a horseshoe crab neutralizes LPS-induced lethality; NGUAN SOON TAN, BOW HO, JEAK LING DING; 14; 7; 2000; 859-870; 10.1096/fasebj.14.7.859; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (7件)： カブトガニ ,  ドラフト ,  ゲノム ,  進化 ,  シナリオ ,  発達 ,  自然免疫