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J-GLOBAL ID:202002235580400203   整理番号:20A1586954

14のリンゴAP2/ERF転写因子遺伝子のクローニングと発現分析【JST・京大機械翻訳】

Cloning and Expression Analysis of Fourteen AP2/ERF Transcription Factors in Apple
著者 (4件):
資料名:
巻: 34  号:ページ: 921-931  発行年: 2020年 
JST資料番号: C2036A  ISSN: 1000-8551  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: 中国 (CHN)  言語: 中国語 (ZH)
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本研究は,リンゴ(MaluspumilaMill.)の成長,発育,および生物または非生物的ストレス応答におけるAP2/ERF転写因子の機能を研究するために,相同アラインメントと逆転写-ポリメラーゼ連鎖反応(RT-PCR)法を利用した。リンゴMdAP2/ERFの完全長cDNA配列をクローニングし,バイオインフォマティクス分析を行った。MdAP2/ERFの16種の異なる組織を,Array法により検出した。MdAP2/ERFがリンゴ斑点の落葉病菌(Alternariaalternataapplepathotype,AAAP)の感染下の発現特性をRNA-seq技術で検出した。MdAP2/ERFの発現パターンは,NaClとマンニトールストレスの下でRT-qPCRによって検出した。【結果】MdERF9-10,MdERF12-15,MdERF20-21,MdERF30,MdERF37およびMdAP2D66-69の14のMdAP2/ERF遺伝子を得た。GenBank登録番号は,MG099818-19,MG099821-24,MG099829-30,MG099839,MG099846およびMG099855-58であり,オープンリーディングフレーム(ORF)は,それぞれ966および966であった。540、1260、843、1056、1011、1347、1047、669、615、1956、1455、1365と1101bp。進化解析は,MdERF12,MdERF37,MdERF20が,それぞれ,DREBサブファミリーA-2,A-4およびA-6に属することを示した。MdERF30、MdERF15、MdERF14/MdERF21とMdERF9/MdERF10/MdERF13はそれぞれERFサブファミリーB-1、B-3、B-5とB-6群に属する。MdAP2D66-69はAP2サブファミリーに属する。MdERF9-10、MdERF12-15、MdERF20、MdERF37とMdAP2D66-69は細胞核に位置し、MdERF21はミトコンドリアに位置している可能性があることを、亜細胞定位予測の結果が示した。Array分析の結果、14個のMdAP2/ERFは16個の検査組織で異なる相対発現レベルを示した。RNA-seqの結果は,MdERF12,MdERF14,MdERF15,MdERF20およびMdAP2D66/67/69が,斑点落葉病菌に感染したことを示した(P>0.05)。150mmolL-1NaCl処理下で,MdERF10,MdERF12,MdERF13,MdERF15,MdERF20,MdERF30およびMdERF37の転写レベルは上方制御された。しかし,MdERF14とMdAP2D68の転写レベルは下方制御された。MdERF10,MdERF37およびMdAP2D66-69の転写レベルは,300mmolL-1マンニトール処理下で上方制御され,MdERF14転写レベルは下方制御された。まとめると、MdAP2/ERF遺伝子は構成的発現を呈し、斑点落葉病菌、NaCl或いはマンニトールストレスによって誘導或いはダウンレギュレーションされ、リンゴの生物ストレスと非生物的ストレス応答の過程の調節に関与している可能性がある。この研究結果は、AP2/ERF転写因子がリンゴの成長発育とストレスストレスのメカニズムを調節するメカニズムについて、理論基礎を築いた。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】
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, 【Automatic Indexing@JST】
分類 (2件):
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トウモロコシ  ,  分子遺伝学一般 
物質索引 (1件):
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