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J-GLOBAL ID：202002235873088186   整理番号：20A2059481

16s rRNAメタゲノム解析はインドのアラビア海沿岸におけるCrtlとCruF遺伝子の優位性を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

16s rRNA metagenomic analysis reveals predominance of Crtl and CruF genes in Arabian Sea coast of India

著者 (4件)： Moopantakath Jamseel (Department of Genomic Science, Central University of Kerala, Tejaswini Hills, Periya, Kasaragod 671320, Kerala, India) ,  Imchen Madangchanok (Department of Genomic Science, Central University of Kerala, Tejaswini Hills, Periya, Kasaragod 671320, Kerala, India) ,  Siddhardha Busi (Department of Microbiology, School of Life Sciences, Pondicherry University, Puducherry 605014, India) ,  Kumavath Ranjith (Department of Genomic Science, Central University of Kerala, Tejaswini Hills, Periya, Kasaragod 671320, Kerala, India)
資料名： Science of the Total Environment  (Science of the Total Environment)
巻： 743  ページ： Null  発行年： 2020年 
JST資料番号： C0501B  ISSN： 0048-9697  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 微生物群集は,異なる生態系で重要な生物地球化学的循環を行う。好塩性微生物群落は,塩水地域に豊富である。したがって,ハロアーキアは,ハロアーキルカロチノイド生合成を利用する目的で,塩生と海洋生物システムで主に研究されている。本研究では,インドのアラビア沿岸地域を横断するいくつかの異なる生物システム(マングローブ,海浜,河口,河川,湖,塩汎および島)からの堆積物を収集し,16s rRNAメタゲノムおよび全ゲノムアプローチによって分析し,主要な代表的ジャンル,ハロアーキル多様性,およびCrtlおよびCruF遺伝子の罹患率を明らかにした。マングローブ堆積物(794OTU)の微生物多様性は湖と河川(558~560OTU)で最も高く,最低であった。さらに,細菌ドメインはすべての生物系(96.00~99.45%)で優勢であった。トップ10の豊富な属は,硫黄,メタン,アンモニア,炭化水素分解と抗生物質生産のような生化学サイクルに関与した。古細菌は,主にHalarchaea,Methanobacteria,Methanococci,MethanomicrobiaおよびCrenarchaeotaから成った。カロチノイド遺伝子,Crtlは,微生物群集の主要な部分(豊度60%;多様性45%)で観察された。興味深いことに,海洋生物系と同様に新鮮で表されるハロアーキルクラス下の全ての種がCruF遺伝子(バクタービリンカロチノイド)をコードすることを見出した。本研究は,種々の生態系における高い微生物多様性,Crtl遺伝子の濃縮を示し,また,CrtlとCruF遺伝子が好塩性属において高度に豊富であることを示した。生態系特異的CrtlとCruFコード化属の知見は,広範囲の天然生物系からカロチノイド誘導体をバイオプロスペクティブする有望な領域を開く。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 細菌 ,  河川 ,  アンモニア ,  カロチノイド ,  *rRNA ,  *遺伝子 ,  ミクロフローラ ,  海洋生物 ,  好塩性 ,  生態系 ,  マングローブ ,  古細菌 ,  アルカン
準シソーラス用語： *メタゲノム ,  微生物多様性 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 16s RNAメタゲノミクス ,  CruF遺伝子 ,  微生物生態学 ,  ハロ古細菌 ,  カロテノイド ,  バクテリオルベリン

分類 (2件)： 微生物に対する影響  (EE05020V) ,  環境問題  (SA01020V)

物質索引 (1件)： メタン

タイトルに関連する用語 (7件)： rRNA ,  メタゲノム解析 ,  インド ,  アラビア海 ,  沿岸 ,  遺伝子 ,  優位性