文献

J-GLOBAL ID：202002236088676508   整理番号：20A1739982

かさ高い分離RNA-Seqは,うどんこ病に対する中国のコムギ品種Jimai 23の明確な発現プロファイリングを明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Bulked Segregant RNA-Seq Reveals Distinct Expression Profiling in Chinese Wheat Cultivar Jimai 23 Responding to Powdery Mildew

著者 (18件)： Zhu Tong (School of Life Sciences, Yantai University, Yantai, China) ,  Wu Liru (School of Life Sciences, Yantai University, Yantai, China) ,  He Huagang (School of Food and Biological Engineering, Jiangsu University, Zhenjiang, China) ,  Song Jiancheng (School of Life Sciences, Yantai University, Yantai, China) ,  Jia Mengshu (School of Life Sciences, Yantai University, Yantai, China) ,  Liu Liancheng (Beijing Biomics Technology Company Limited, Beijing, China) ,  Wang Xiaolu (Crop Research Institute, Shandong Academy of Agricultural Sciences, Jinan, China) ,  Han Ran (Crop Research Institute, Shandong Academy of Agricultural Sciences, Jinan, China) ,  Niu Liping (State Key Laboratory of Hybrid Rice, College of Life Sciences, Wuhan University, Wuhan, China) ,  Du Wenxiao (School of Life Sciences, Yantai University, Yantai, China) ,  Zhang Xu (School of Life Sciences, Yantai University, Yantai, China) ,  Wang Wenrui (School of Life Sciences, Yantai University, Yantai, China) ,  Liang Xiao (School of Life Sciences, Yantai University, Yantai, China) ,  Li Haosheng (Crop Research Institute, Shandong Academy of Agricultural Sciences, Jinan, China) ,  Liu Jianjun (Crop Research Institute, Shandong Academy of Agricultural Sciences, Jinan, China) ,  Xu Hongxing (State Key Laboratory of Crop Stress Adaptation and Improvement, School of Life Sciences, Henan University, Kaifeng, China) ,  Liu Cheng (Crop Research Institute, Shandong Academy of Agricultural Sciences, Jinan, China) ,  Ma Pengtao (School of Life Sciences, Yantai University, Yantai, China)
資料名： Frontiers in Genetics (Web)  (Frontiers in Genetics (Web))
巻： 11  ページ： 474  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7071A  ISSN： 1664-8021  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Blumeria graminis f.sp.tritici(Bgt)によって引き起こされるコムギうどんこ病は,世界的なコムギ生産を脅かす最も破壊的な真菌病害の1つである。宿主耐性は,この疾患を制御する最も効率的な方法であることが知られている。しかし,コムギうどんこ病耐性(Pm)の分子機構はまだ不明である。Pmの分子機構を分析するために,耐性コムギ品種Jimai23を用いて,その潜在的耐性成分を調べ,そして,バルク分離RNA-Seq(BSR-Seq)を用いてうどんこ病感染に応答したその発現を調べた。Jimai23のPmは,PmJM23を暫定的に指定した単一優性遺伝子により提供され,染色体5DSのPm2ドメインに割り当てられることを示した。3,816の一貫して異なるSNPを耐性親と感受性親の間で呼び,耐性親Jimai23とSNPの感受性親Tainong18.58の間の組合せに由来するバルキングプールをPmJM23の候補領域に割り当てた。その後,親とバルクの間の3,803の差次的発現遺伝子(DEG)を,GO,COGとKEGG経路濃縮によって分析した。Bgt接種後の関連遺伝子の時間的発現パターンをRT-qPCRによりさらに測定した。6つの疾患関連遺伝子の発現を,Bgt感染の間に研究し,Bgtへの耐性の改善のための貴重な遺伝資源として役立つ可能性がある。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： プロメチウム ,  *RNA【核酸】 ,  遺伝子 ,  *コムギ ,  真菌症 ,  *品種 ,  *うどんこ病 ,  バルキング ,  遺伝資源 ,  定量的PCR法
準シソーラス用語： 優性遺伝子 ,  分子機構 ,  KEGG ,  差次的遺伝子発現 ,  遺伝子発現パターン , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： コムギ ,  うどんこ病 ,  BSR-Seq ,  発現プロファイリング ,  DEG

分類 (2件)： 菌類による植物病害  (FC04052Y) ,  麦  (FC03033M)

引用文献 (63件)：

• Abe A., Kosugi S., Yoshida K., Natsume S., Takagi H., Kanzaki H. (2012). Genome sequencing reveals agronomically important loci in rice using MutMap. Nat. Biotechnol. 30 174-178. doi: 10.1038/nbt.2095
• An D. G., Zheng Q., Zhou Y. L., Ma P. T., Lv Z. L., Li L. H., et al (2013). Molecular cytogenetic characterization of a new wheat-rye 4R chromosome translocation line resistant to powdery mildew. Chromosome Res. 21 419-432. doi: 10.1007/s10577-013-9366-8
• Boyle E. I., Weng S., Gollub J., Jin H., Botstein D., Cherry J. M., et al (2004). GO: termfinder-open source software for accessing gene ontology information and finding significantly enriched gene ontology terms associated with a list of genes. Bioinformatics 20 3710-3715. doi: 10.1093/bioinformatics/bth456
• Braeken K., Daniels R., Ndayizeye M., Vanderleyden J., Michiels J. (2008). “"Quorum sensing in bacteria-plant interactions,"” in Molecular Mechanisms of Plant and Microbe Coexistence. Soil Biology, Vol. 15 eds Nautiyal C. S., Dion P. (Berlin: Springer). doi: 10.1093/bioinformatics/bth456
• Chen F., Jia H. Y., Zhang X. J., Qiao L. Y., Li X., Zheng J., et al (2019). Positional cloning of PmCH1357 reveals the origin and allelic variation of the Pm2 gene for powdery mildew resistance in wheat. Crop J. 7 771-783. doi: 10.1016/j.cj.2019.08.004

タイトルに関連する用語 (7件)： かさ ,  うどんこ病 ,  中国 ,  コムギ ,  品種 ,  発現 ,  プロファイリング