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J-GLOBAL ID：202002236516379036   整理番号：20A1687521

結腸直腸癌の潜在的予後バイオマーカーとしてのPALB2【JST・京大機械翻訳】

PALB2 as a potential prognostic biomarker for colorectal cancer

著者 (6件)： Pan Weiyu (Department of Pathology, Qingpu Branch of Zhongshan Hospital, Fudan University, No. 1158 East Park Road, Qingpu District, Shanghai 200032, PR China) ,  Lu Kui (Department of Pathology, Qingpu Branch of Zhongshan Hospital, Fudan University, No. 1158 East Park Road, Qingpu District, Shanghai 200032, PR China) ,  Wang Weixia (Department of Pathology, Qingpu Branch of Zhongshan Hospital, Fudan University, No. 1158 East Park Road, Qingpu District, Shanghai 200032, PR China) ,  Yao Junxia (Department of Pathology, Qingpu Branch of Zhongshan Hospital, Fudan University, No. 1158 East Park Road, Qingpu District, Shanghai 200032, PR China) ,  Hou Yingyong (Department of Pathology, Qingpu Branch of Zhongshan Hospital, Fudan University, No. 1158 East Park Road, Qingpu District, Shanghai 200032, PR China) ,  Hou Yingyong (Department of Pathology, Zhongshan Hospital, Fudan University, Shanghai 201700, PR China)
資料名： Computational Biology and Chemistry  (Computational Biology and Chemistry)
巻： 87  ページ： Null  発行年： 2020年 
JST資料番号： H0201B  ISSN： 1476-9271  CODEN： COCHDK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： BRCA2(PALB2)のパートナーと局在性は結腸直腸癌(CRC)リスク遺伝子と考えられているが,CRCにおけるPALB2の予後的含意は不明のままである。本研究では,癌ゲノムアトラス(TCGA)データベースにおける遺伝子コピー数変化(CNA)とPALB2のmRNA発現の予後的価値を評価し,データベースで検証した。TCGAデータベースからPALB2のコピー数とmRNAデータをダウンロードし,遺伝的変化,発現レベルと生存結果の間の関係を調べた。遺伝子オントロジー(GO)分析を行って,PALB2.cBioPortalデータベースの機能を研究し,PALB2の潜在的共発現遺伝子を調査した。PALB2遺伝子欠失と診断されたCRC患者の6.3%(582例)があった。PALB2欠失群は,非欠失群よりPALB2 mRNAの有意に低かった(P<0.001)。生存分析は,PALB2欠失が,より短い無病生存率(DFS)(P=0.026)と全生存率(OS)(P=0.028)と有意に関連することを示した。PALB2の低mRNA発現は,より短いOSと相関した(P<0.001)。また,多変量解析により,PALB2欠失およびPALB2の低mRNA発現は,CRCにおける不良OSの独立予後因子であった(それぞれP=0.019,0.034)。検証コホートにおいて,PALB2の陰性発現は,ステージI患者におけるより短いOS(P=0.006)と関連していた。多変量解析により,PALB2の陰性発現は予後不良因子であった(P=0.002)。GO分析と共発現分析は,PALB2が主にDNA修復過程に関与することを示した。これらの結果は,PALB2遺伝子コピー数欠失と低mRNA発現がCRCの新しい予後バイオマーカーである可能性を示唆する。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 多変量解析 ,  データベース ,  DNA【核酸】 ,  mRNA ,  遺伝 ,  遺伝子 ,  DNA修復 ,  *予後 ,  母集団 ,  コピー数 ,  *バイオマーカー
準シソーラス用語： 共発現 ,  *結腸直腸癌 ,  全生存率 ,  mRNA発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： PALB2 ,  DNAコピー数変化 ,  大腸癌 ,  予後 ,  バイオマーカー

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (4件)： 結腸直腸癌 ,  予後 ,  バイオマーカー ,  PALB2