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J-GLOBAL ID：202002236724855216   整理番号：20A1825012

2型糖尿病におけるlncRNA-circRNA-miRNA-mRNAネットワークのハイスループット配列決定と探索【JST・京大機械翻訳】

High-Throughput Sequencing and Exploration of the lncRNA-circRNA-miRNA-mRNA Network in Type 2 Diabetes Mellitus

著者 (11件)： Yang Fang (Department of Health Management Center, the First Hospital of Jilin University, Jilin University, Changchun, Jilin, 130021, China) ,  Chen Yang (Epidemiology and Biostatistics, School of Public Health, Jilin University, Changchun, Jilin, China130021,) ,  Xue Zhiqiang (Department of Epidemiology and Statistics, School of Public Health, Xinjiang Medical University, Urumqi, China830011,) ,  Lv Yaogai (Epidemiology and Biostatistics, School of Public Health, Jilin University, Changchun, Jilin, China130021,) ,  Shen Li (Department of Hospital Infection Management, Zhengzhou People’s Hospital, Zhengzhou, Henan, China450000,) ,  Li Kexin (Epidemiology and Biostatistics, School of Public Health, Jilin University, Changchun, Jilin, China130021,) ,  Zheng Pingping (Epidemiology and Biostatistics, School of Public Health, Jilin University, Changchun, Jilin, China130021,) ,  Pan Pan (Epidemiology and Biostatistics, School of Public Health, Jilin University, Changchun, Jilin, China130021,) ,  Feng Tianyu (Epidemiology and Biostatistics, School of Public Health, Jilin University, Changchun, Jilin, China130021,) ,  Jin Lina (Epidemiology and Biostatistics, School of Public Health, Jilin University, Changchun, Jilin, China130021,) ,  Yao Yan (Epidemiology and Biostatistics, School of Public Health, Jilin University, Changchun, Jilin, China130021,)
資料名： BioMed Research International (Web)  (BioMed Research International (Web))
巻： 2020  ページ： Null  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7008A  ISSN： 2314-6133  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 目的:長い非コードRNA(lncRNA)と円形RNA(circRNA)は,糖尿病研究においてますます注目を集めている。しかし,更なる研究を必要とする多くの未知のlncRNAとcircRNAが存在する。本研究の目的は,2型糖尿病(T2DM)における新しいlncRNAとcircRNAとそれらの潜在的生物学的機能を同定することである。【方法】RNA配列決定と差次的発現分析を用いて,T2DMと対照群の間で異常に発現した非コードRNA(ncRNAs)とmRNAを同定した。競合的内因性RNA(ceRNA)調節ネットワークは,遺伝子発現を調節するlncRNAとcircRNAの機序を明らかにした。lncRNAとcircRNAの生物学的機能を遺伝子オントロジー(GO)と遺伝子およびゲノム(KEGG)濃縮分析の京都エンシクロペディアにより分析した。候補ハブmRNAを蛋白質-蛋白質相互作用(PPI)ネットワークにより選択し,遺伝子発現Omnibus(GEO)データベースを用いて検証した。【結果】差次的発現分析結果は,441lncRNA(366が上方制御された,そして,75の下方制御),683のcircRNA(354の上方制御,および329の下方制御),93のmiRNA(63の上方制御と30の下方制御),および2923のmRNA(上方制御されたと1779の下方制御された)が,T2DM群で著しく差次的に発現したことを示した。ceRNA調節ネットワークは,単一lncRNAとcircRNAが複数のmiRNAと会合し,さらにそれらはより多くのmRNAを共調節することを示した。機能解析は,差次的に発現したlncRNA(DElncRNA)と差次的に発現したcircRNA(DEcircRNA)がmTORシグナル伝達経路,リソソーム経路,アポトーシス経路,および結核経路において重要な役割を果たすかもしれないことを示した。さらに,PIK3R5,AKT2,およびCLTAは,PPIネットワークを確立することによって,重要な経路に富んでいたハブmRNAであった。結論.本研究は,lncRNAとcircRNAによって結合したceRNAネットワークを通して,T2DMにおけるlncRNAとcircRNAの分子機構を探究する最初の研究である。本研究は,ceRNA調節ネットワークからのT2DMへの新規洞察を提供する。Copyright 2020 Fang Yang et al. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  *ネットワーク ,  *RNA【核酸】 ,  *mRNA ,  遺伝子 ,  生物活性 ,  機能分析 ,  遺伝子発現 ,  ダウンレギュレーション ,  アップレギュレーション ,  *2型糖尿病 ,  アポトーシス
準シソーラス用語： *マイクロRNA ,  分子機構 ,  差次的遺伝子発現 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (34件)：

• L. Chen, D. J. Magliano, P. Z. Zimmet, "The worldwide epidemiology of type 2 diabetes mellitus-present and future perspectives," Nature Reviews Endocrinology, vol. 8, no. 4, pp. 228-236, 2011.
• D. R. Whiting, L. Guariguata, C. Weil, J. Shaw, "IDF Diabetes Atlas: global estimates of the prevalence of diabetes for 2011 and 2030," Diabetes Research and Clinical Practice, vol. 94, no. 3, pp. 311-321, 2011.
• L. Guariguata, D. R. Whiting, I. Hambleton, J. Beagley, U. Linnenkamp, J. E. Shaw, "Global estimates of diabetes prevalence for 2013 and projections for 2035," Diabetes Research and Clinical Practice, vol. 103, no. 2, pp. 137-149, 2014.
• K. Ogurtsova, J. D. da Rocha Fernandes, Y. Huang, U. Linnenkamp, L. Guariguata, N. H. Cho, D. Cavan, J. E. Shaw, L. E. Makaroff, "IDF Diabetes Atlas: global estimates for the prevalence of diabetes for 2015 and 2040," Diabetes Research and Clinical Practice, vol. 128, pp. 40-50, 2017.
• N. H. Cho, J. E. Shaw, S. Karuranga, Y. Huang, J. D. da Rocha Fernandes, A. W. Ohlrogge, B. Malanda, "IDF Diabetes Atlas: global estimates of diabetes prevalence for 2017 and projections for 2045," Diabetes Research and Clinical Practice, vol. 138, pp. 271-281, 2018.

タイトルに関連する用語 (7件)： 2型糖尿病 ,  lncRNA ,  circRNA ,  miRNA ,  mRNA ,  ハイスループット ,  探索