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J-GLOBAL ID：202002236756580346   整理番号：20A1182319

霊長類CD4+T細胞における調節要素アンサンブルの動的進化【JST・京大機械翻訳】

Dynamic evolution of regulatory element ensembles in primate CD4⁺ T cells

著者 (20件)： Danko Charles G. (Baker Institute for Animal Health, College of Veterinary Medicine, Cornell University, Ithaca, NY, USA) ,  Danko Charles G. (Department of Biomedical Sciences, College of Veterinary Medicine, Cornell University, Ithaca, NY, USA) ,  Choate Lauren A. (Baker Institute for Animal Health, College of Veterinary Medicine, Cornell University, Ithaca, NY, USA) ,  Marks Brooke A. (Baker Institute for Animal Health, College of Veterinary Medicine, Cornell University, Ithaca, NY, USA) ,  Rice Edward J. (Baker Institute for Animal Health, College of Veterinary Medicine, Cornell University, Ithaca, NY, USA) ,  Wang Zhong (Baker Institute for Animal Health, College of Veterinary Medicine, Cornell University, Ithaca, NY, USA) ,  Chu Tinyi (Baker Institute for Animal Health, College of Veterinary Medicine, Cornell University, Ithaca, NY, USA) ,  Chu Tinyi (Graduate Field of Computational Biology, Cornell University, Ithaca, NY, USA) ,  Martins Andre L. (Baker Institute for Animal Health, College of Veterinary Medicine, Cornell University, Ithaca, NY, USA) ,  Martins Andre L. (Graduate Field of Computational Biology, Cornell University, Ithaca, NY, USA) ,  Dukler Noah (Simons Center for Quantitative Biology, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, NY, USA) ,  Dukler Noah (Tri-Institutional Training Program in Computational Biology and Medicine, New York, NY, USA) ,  Coonrod Scott A. (Baker Institute for Animal Health, College of Veterinary Medicine, Cornell University, Ithaca, NY, USA) ,  Coonrod Scott A. (Department of Biomedical Sciences, College of Veterinary Medicine, Cornell University, Ithaca, NY, USA) ,  Tait Wojno Elia D. (Baker Institute for Animal Health, College of Veterinary Medicine, Cornell University, Ithaca, NY, USA) ,  Tait Wojno Elia D. (Department of Microbiology and Immunology, College of Veterinary Medicine, Cornell University, Ithaca, NY, USA) ,  Lis John T. (Department of Molecular Biology and Genetics, Cornell University, Ithaca, NY, USA) ,  Kraus W. Lee (Laboratory of Signaling and Gene Regulation, Cecil H. and Ida Green Center for Reproductive Biology Sciences, University of Texas Southwestern Medical Center, Dallas, TX, USA) ,  Kraus W. Lee (Division of Basic Research, Department of Obstetrics and Gynecology, University of Texas Southwestern Medical Center, Dallas, TX, USA) ,  Siepel Adam (Simons Center for Quantitative Biology, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, NY, USA)
資料名： Nature Ecology & Evolution  (Nature Ecology & Evolution)
巻： 2  号： 3  ページ： 537-548  発行年： 2018年 
JST資料番号： W4775A  ISSN： 2397-334X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： エンハンサーにおける進化的変化が標的遺伝子の転写にどのように影響するかは重要な未解決の問題である。遺伝子発現の以前の比較研究は,転写後調節過程により影響されるメッセンジャーRNAの存在量を大きく測定し,したがって,発現差の基礎となる機構についての推論を制限する。ここでは,霊長類種における初期転写を直接測定し,転写後調節から転写を分離することを可能にした。著者らは,複数のヒト,チンパンジーおよびアカゲザル個体における静止および活性化CD4+T細胞においてRNAポリメラーゼをマップするために精密ランおよび配列決定を使用し,げっ歯類をアウトグループとした。著者らは,コード化および非コード化転写における一般的な保存を観察し,特に遠位エンハンサーおよび非コードRNAにおいて,種間の多数の差異により穿刺された。より多くのエンハンサーにより調節される遺伝子は,個々のエンハンサーにおける保存の減少にもかかわらず,進化的に安定なレベルでより頻繁に転写される。適応性ヌクレオチド置換は系統特異的転写と関連し,1つの遺伝子座,SGPP2において,複数の置換がヒト特異的転写に寄与することを予測し実験的に検証した。まとめると,著者らの知見は,標的遺伝子を共同的に調節するエンハンサーの集合を通しての進化的補償に対する広範な役割を示唆する。エンハンサーにおける進化的変化が標的遺伝子の転写にどのように影響するかは不明である。霊長類におけるCD4+T細胞における新生転写の測定により,エンハンサーにおける進化的変化の影響は転写レベルで緩衝されることを示した。Copyright The Author(s) 2018 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： mRNA ,  RNAポリメラーゼ ,  遺伝子 ,  *調節遺伝子 ,  ヌクレオチド ,  ヒト ,  *霊長類 ,  齧歯類 ,  チンパンジー ,  アカゲザル ,  遺伝子発現 ,  穿刺
準シソーラス用語： *CD4陽性T細胞 ,  非翻訳RNA ,  標的遺伝子 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (5件)： 霊長類 ,  CD4+T細胞 ,  調節要素 ,  アンサンブル ,  進化