文献

J-GLOBAL ID：202002237473722932   整理番号：20A0498769

mRNAアレイにおけるプローブシグナル値は結核における好中球FCGR1の過剰な関与を示唆する【JST・京大機械翻訳】

Probe Signal Values in mRNA Arrays Imply an Excessive Involvement of Neutrophil FCGR1 in Tuberculosis

著者 (9件)： Wu Kang (Key Laboratory of Medical Molecular Virology of MOE/MOH, Shanghai Public Health Clinical Center, Fudan University, Shanghai, China) ,  Wu Kang (School of Laboratory Medicine and Life Science, Wenzhou Medical University, Wenzhou, China) ,  Wu Kang (TB Center, Shanghai Emerging and Re-emerging Institute, Shanghai, China) ,  Li Meng (Department of Life Science, Bengbu Medical College, Bengbu, China) ,  Chen Zhen-yan (Key Laboratory of Medical Molecular Virology of MOE/MOH, Shanghai Public Health Clinical Center, Fudan University, Shanghai, China) ,  Lowrie Douglas B. (Key Laboratory of Medical Molecular Virology of MOE/MOH, Shanghai Public Health Clinical Center, Fudan University, Shanghai, China) ,  Lowrie Douglas B. (TB Center, Shanghai Emerging and Re-emerging Institute, Shanghai, China) ,  Fan Xiao-Yong (School of Laboratory Medicine and Life Science, Wenzhou Medical University, Wenzhou, China) ,  Fan Xiao-Yong (TB Center, Shanghai Emerging and Re-emerging Institute, Shanghai, China)
資料名： Frontiers in Medicine (Web)  (Frontiers in Medicine (Web))
巻： 7  ページ： 19  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7079A  ISSN： 2296-858X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： トランスクリプトームからの摂動遺伝子は,対照試料に対する相対的な発現に関してしばしば提示される。しかしながら,蛋白質豊度を意味する遺伝子のプローブ信号値(PSVs)はしばしば無視される。ここでは,結核(TB)関連シグネチャ遺伝子におけるPSVを調べた。Mycobacterium tuberculosis感染THP-1細胞からの特徴は,誘導された(TMtb-i,誘導されたTMtb-iNetを伴う)および抑制された(TMtb-r)と定義された。ヒト血液からの特徴は肺TB(PTB)特異的特徴(PTBsig)と定義された。分析は,感染の前に,TMtb-iとTMtb-iNetにはより低いPSVsがあり,TMtb-r遺伝子には平均PSVsがあったことを示した。健常ドナーの血液において,PTBsig(アップレギュレーションされたPTBsigUpと下方制御されたPTBsigDn)は平均PSVsを示した。これは血液の細胞不均一性によるマスキングによるものであった。構成細胞集団(CD4/8+T,単球および好中球)において多様なPSVsが見られた。特に,健常ドナーの好中球におけるPTBsigUpのPSVsはより高く(より高い蛋白質豊度を意味する),PTBの好中球においてより高かった(過剰な蛋白質存在量を意味する)。4つの細胞集団におけるPTBsigUpのPSVパターンに基づいて,著者らは3つの代表的高度相同遺伝子(FCGR1A,FCGR1B,および偽遺伝子FCGR1CP)を同定した。それらの合計PSVsはPTB患者および健常ドナーの好中球において最も高かった。3つの遺伝子は,RNA-seqに基づく分析において検証されたように,PTBの血液における化学療法に対してすべて上方制御され,反応性であった。このPSVに基づく研究は,PTBにおける好中球FCGR1の過剰な関与を確認する。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *結核 ,  タンパク質 ,  摂動 ,  アップレギュレーション ,  結核菌 ,  CD4抗原 ,  遺伝子 ,  単球 ,  *好中球 ,  薬物療法 ,  トランスクリプトーム ,  ヒト ,  ドナー ,  *mRNA ,  ダウンレギュレーション

著者キーワード (6件)： 結核菌 ,  全血 ,  好中球 ,  遺伝子署名 ,  プローブ信号値 ,  IgG受容体IのFcフラグメント

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  感染症・寄生虫症一般  (GD01010H)

引用文献 (36件)：

• Berry MP, Blankley S, Graham CM, Bloom CI, O'Garra A. Systems approaches to studying the immune response in tuberculosis. Curr Opin Immunol. (2013) 25:579-87. doi: 10.1016/j.coi.2013.08.003
• Arlehamn CL, Seumois G, Gerasimova A, Huang C, Fu Z, Yue X, et al. Transcriptional profile of tuberculosis antigen-specific T cells reveals novel multifunctional features. J Immunol. (2014) 193:2931-40. doi: 10.4049/jimmunol.1401151
• Tailleux L, Waddell SJ, Pelizzola M, Mortellaro A, Withers M, Tanne A, et al. Probing host pathogen cross-talk by transcriptional profiling of both Mycobacterium tuberculosis and infected human dendritic cells and macrophages. PLoS ONE. (2008) 3:e1403. doi: 10.1371/journal.pone.0001403
• Orlova MO, Majorov KB, Lyadova IV, Eruslanov EB, M'lan CE, Greenwood CM, et al. Constitutive differences in gene expression profiles parallel genetic patterns of susceptibility to tuberculosis in mice. Infect Immun. (2006) 74:3668-72. doi: 10.1128/IAI.00196-06
• Beisiegel M, Mollenkopf HJ, Hahnke K, Koch M, Dietrich I, Reece ST, et al. Combination of host susceptibility and Mycobacterium tuberculosis virulence define gene expression profile in the host. Eur J Immunol. (2009) 39:3369-84. doi: 10.1002/eji.200939615

タイトルに関連する用語 (6件)： mRNA ,  アレイ ,  プローブ ,  シグナル ,  結核 ,  好中球