拡大した遺伝的アルファベット転写により強化されたナノ粒子による大きなRNAの部位特異的共有結合標識【JST・京大機械翻訳】

Wang Yan; Chen Yaoyi; Hu Yanping; Fang Xianyang

文献

J-GLOBAL ID：202002238206418917 整理番号：20A2292915

拡大した遺伝的アルファベット転写により強化されたナノ粒子による大きなRNAの部位特異的共有結合標識【JST・京大機械翻訳】

Site-specific covalent labeling of large RNAs with nanoparticles empowered by expanded genetic alphabet transcription

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巻： 117 号： 37 ページ： 22823-22832 発行年： 2020年
JST資料番号： D0387A ISSN： 0027-8424 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

ナノ粒子(NP)とのRNAの結合は生物学および医学における多数の応用のため非常に重要であるが,それは特に大きなものに対して依然として困難である。今まで,RNA標識の大部分は,固相化学合成に依存しており,これは一般的に100ヌクレオチド(nts)より小さいRNAに限定されている。ここでは,A-T/UとG-C天然塩基対(bps)とTPT3-NaM非天然塩基対(UBP)を含む拡張遺伝子アルファベットの転写により,金ナノ粒子(Nanogold)と大きなRNAの部位特異的共有結合共役のための効率的で一般的に適用可能な標識戦略を提示する。アミン誘導体化TPT3(TPT3A)を合成し,これはin vitro T7転写によりDengueウイルス血清型2(DENV2)から97-nt3′SL RNAと719-ntミニゲノムRNA(DENV-mini)に特異的に結合する部位である。TPT3A修飾RNAは,アミンとNHSエステル反応によってモノ-スルホ-N-ヒドロキシスクシンイミジル(NHS)-ナノ金NPと共有結合し,非変性条件下でさらに精製した。TPT3修飾およびナノ金標識は,円偏光二色性,小角X線散乱(SAXS)および結合活性アッセイにより,RNAに対する最小構造摂動を引き起こす。新たな分子規則,X線散乱干渉法(XSI)による大きなRNA構造生物学におけるナノ金-RNA複合体の応用を示した。XSI測定に由来する3′SLとDENV-ミニRNAのナノ粒子間距離分布はフラビウイルスゲノム環状化の仮説モデルを支持し,この標識戦略の適用性を検証した。本戦略は,従来のRNA標識戦略におけるサイズ制約を克服し,大きなRNA構造生物学およびRNAナノテクノロジーにおいて広い応用を有することが期待される。Copyright 2020 The Author(s). Published by PNAS. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

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遺伝子発現 , 分子構造

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