文献

J-GLOBAL ID：202002238209888682   整理番号：20A0868604

生態毒性モジュール:生態学的種からの毒性ゲノミクスデータを組織化し分析するためのカスタム遺伝子セット【JST・京大機械翻訳】

EcoToxModules: Custom Gene Sets to Organize and Analyze Toxicogenomics Data from Ecological Species

著者 (6件)： Ewald Jessica D. (Faculty of Agricultural and Environmental Sciences, McGill University, Canada) ,  Soufan Othman (Faculty of Agricultural and Environmental Sciences, McGill University, Canada) ,  Crump Doug (Ecotoxicology and Wildlife Health Division, Environment and Climate Change Canada, National Wildlife Research Centre, Canada) ,  Hecker Markus (School of the Environment&Sustainability and Toxicology Centre, University of Saskatchewan, Canada) ,  Xia Jianguo (Faculty of Agricultural and Environmental Sciences, McGill University, Canada) ,  Basu Niladri (Faculty of Agricultural and Environmental Sciences, McGill University, Canada)
資料名： Environmental Science & Technology  (Environmental Science & Technology)
巻： 54  号： 7  ページ： 4376-4387  発行年： 2020年 
JST資料番号： B0839A  ISSN： 0013-936X  CODEN： ESTHA  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： トキシコゲノミクス研究からの伝統的な結果は,明確な解釈により活性化できる結果まで合成することが困難な,有意に影響された遺伝子または遺伝子セットの複雑なリストである。ここでは,(1)毒性学的枠組みへの事前に定義された分子経路と(2)環境汚染物質への曝露により影響される遺伝子のデータ駆動,教師なしグループ化を提供する,機能的および統計的EcoToxModulesと呼ばれる21のカスタム遺伝子セットの2セットを定義した。機能的EcoToxModulesは,エキスパート科学者と調節因子からの入力に基づく生態毒性学により関連する生物学的プロセスにKEGG経路を再編成することによって同定された。38の異なる条件に暴露した後に,ファットヘッドミノーの肝臓で測定された公的に利用可能なマイクロアレイデータ(n=303プロファイル)の共発現分析を用いて,統計的EcoToxModulesを同定した。純粋な化学物質と環境廃水試料への曝露を代表する2つの事例研究により,エコToxモジュールの潜在的応用を実証した。差次的発現と遺伝子セット分析との比較において,著者らはEcoToxModule応答がこれらの従来の結果と一致することを見出した。さらに,それらは異なる条件を通して可視化し,定量的に比較することができ,各事例研究における曝露の相対毒性についての結論を引き出した。Copyright 2020 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 化学物質 ,  再編成 ,  事例研究 ,  *遺伝子 ,  毒物学 ,  廃水 ,  *生態学 ,  可視化 ,  DNAマイクロアレイ ,  Pimephales promelas
準シソーラス用語： 共発現 ,  KEGG ,  環境毒物学 ,  環境汚染物質 ,  *生態毒性 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (3件)： その他の汚染原因物質  (SB05040W) ,  下水,廃水の生物学的処理  (SC03060H) ,  水質汚濁一般  (SB02010U)

タイトルに関連する用語 (7件)： 生態毒性 ,  モジュール ,  生態 ,  毒性ゲノミクス ,  組織化 ,  分析 ,  遺伝子