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J-GLOBAL ID：202002238500775868   整理番号：20A2019415

亜鉛結合は銅結合よりもAlzheimerのAβ42ペプチドにおけるより大きな疎水性を促進する:分子動力学と溶媒和熱力学研究【JST・京大機械翻訳】

Zinc binding promotes greater hydrophobicity in Alzheimer’s Aβ42 peptide than copper binding: Molecular dynamics and solvation thermodynamics studies

著者 (7件)： Boopathi Subramanian (Centro de Bioinformatica y Simulacion Molecular (CBSM), Facultad de Ingenieria, Universidad de Talca, Talca, Chile) ,  Dinh Quoc Huy Pham (Institute of Physics, Polish Academy of Sciences, Warsaw, Poland) ,  Gonzalez Wendy (Centro de Bioinformatica y Simulacion Molecular (CBSM), Facultad de Ingenieria, Universidad de Talca, Talca, Chile) ,  Gonzalez Wendy (Millennium Nucleus of Ion Channels-Associated Diseases (MiNICAD), Universidad de Talca, Talca, Chile) ,  Theodorakis Panagiotis E. (Institute of Physics, Polish Academy of Sciences, Warsaw, Poland) ,  Li Mai Suan (Institute of Physics, Polish Academy of Sciences, Warsaw, Poland) ,  Li Mai Suan (Institute for Computational Science and Technology, Quang Trung Software City, Tan Chanh Hiep Ward, Ho Chi Minh City, Vietnam)
資料名： Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics  (Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics)
巻： 88  号： 10  ページ： 1285-1302  発行年： 2020年 
JST資料番号： T0761A  ISSN： 0887-3585  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Aβ42ペプチドの凝集はAlzheimer病発症の主因の一つと考えられている。この状況において,Zn2+とCu2+は,Aβ42の構造と溶媒和自由エネルギーの変化により,凝集機構の調節に重要な役割を果たす。実際には,Aβ42-Zn2+とAβ42-Cu2+ペプチド複合体が本質的に無秩序であり,水性環境において急速な配座転移を示すので,実験的研究は後者の特性を決定できなかった。ここでは,金属結合部位のテンプレートとして量子化学構造を用い,また,完全な溶媒和熱力学解析による広範な全原子分子動力学(MD)シミュレーションを組み合わせることによって,明示的溶媒(水)中のAβ42_,Aβ42-Cu2+およびAβ42-Zn2+系の原子構造変化および溶媒和熱力学を研究した。著者らの結果は,亜鉛と銅の配位が,C末端領域(Met35-Val40)の溶媒和自由エネルギーの大きな減少をもたらし,次に,より高い構造無秩序をもたらすことを示す。対照的に,同じC末端領域でのβシート形成は,Aβ42_xの場合,より高い溶媒和自由エネルギーを示した。Aβ42の溶媒和自由エネルギーは,Cu2+との結合の場合とは対照的に,Leu17-Ala42残基でのβシート構造の形成のより高い傾向により,Zn2+結合により増加した。最後に,水中のAβ42-Zn2+の疎水性がAβ42-Cu2+の場合よりも大きいことを見出した。Copyright 2020 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 自由エネルギー ,  凝集 ,  シミュレーション ,  *亜鉛 ,  *銅 ,  *疎水性 ,  配座転移 ,  *溶媒和 ,  *ペプチド ,  β構造 ,  *分子動力学 ,  量子化学 ,  *Alzheimer病
準シソーラス用語： C末端 ,  *アミロイドβ42 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (8件)： アルツハイマー病 ,  と疎水性 ,  Aβ42 ,  銅 ,  分子動力学 ,  溶媒和熱力学 ,  亜鉛 ,  βシート

分類 (3件)： 神経の基礎医学  (GN01020W) ,  生物学的機能  (EB03040U) ,  蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N)

タイトルに関連する用語 (11件)： 亜鉛 ,  銅 ,  Alzheimer ,  Aβ42 ,  ペプチド ,  疎水性 ,  促進 ,  分子動力学 ,  溶媒和 ,  熱力学 ,  研究