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J-GLOBAL ID：202002238734586568   整理番号：20A1917031

NMRベースメタボロミクスのためのバケット法としての参照スペクトル上の線広がり因子の評価【JST・京大機械翻訳】

Evaluating line-broadening factors on a reference spectrum as a bucketing method for NMR based metabolomics

著者 (3件)： Wang Bo (Department of Chemistry, College of Science and Technology, North Carolina Agricultural and Technical State University, Greensboro, NC, 27411, USA) ,  Maldonado-Devincci Antoniette M. (Department of Psychology, College of Health and Human Sciences, North Carolina Agricultural and Technical State University, Greensboro, NC, 27411, USA) ,  Jiang Lin (Division of Natural Sciences, New College of Florida, 5800 Bay Shore Road, Sarasota, FL, 34243, USA)
資料名： Analytical Biochemistry  (Analytical Biochemistry)
巻： 606  ページ： Null  発行年： 2020年 
JST資料番号： H0177B  ISSN： 0003-2697  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： メタボロミクスに基づく核磁気共鳴(NMR)は,疾患機構分析および薬剤発見で広く使用されている。NMRに基づくメタボロミクス研究における最も重要な因子の1つは,データ解釈において重要な役割を果たすスペクトルバケットの精度である。自動バケティングのために様々な方法が開発されているが,最も一般的な手法は,主に自動バケット法のためのユーザ専門知識の必要条件による従来の長方形バケティング法である。本研究では,ピークバケット精度を効率的に増加させるだけでなく,バケット加工を便利に可視化し,エンドユーザにより調整する新しい自動バケティング法を開発した。この方法は参照スペクトルとして役立つ研究セットの平均スペクトルに線広がり(lb)因子を適用し,参照スペクトルのピーク幅をピークバケットパターンとしてセットした。バケット境界をピックアップする方法は単純であるが,線広がり因子を適用した後に強力であった。0から2lbまでの線広がり因子をマウス糞便試料を用いて試験し,1lb法は注意深い手動バケットパターンと比較して類似のピークパターンとデータ解釈結果を示した。さらに,Amixソフトウェアを使用して,新手法生成パターンを容易に可視化し,過度のデータ科学とNMR装置専門知識なしで一般ユーザによって修正した。要約すると,本研究は,メタボロミクス研究のための柔軟な可視化と調整能力を有するNMRピーク自動バケティングにおける強力で便利なツールを示した。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *NMR【磁気共鳴】 ,  可視化 ,  *スペクトル ,  ソフトウェア ,  バケット ,  必要条件
準シソーラス用語： エンドユーザ ,  *メタボロミクス ,  専門知識 ,  データ解釈 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： メタボロミクス ,  核磁気共鳴 ,  バケット ,  線広がり

分類 (1件)： 有機化合物の物理分析  (CC03034A)

タイトルに関連する用語 (8件)： NMR ,  メタボロミクス ,  バケット ,  参照 ,  スペクトル ,  広がり ,  因子 ,  評価