抄録/ポイント：
抄録/ポイント
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ABSTRACT細菌遺伝子調節は,染色体上の標的に直接結合する数百の転写因子(TFs)によって支配されている。TFsの全体的な研究は,通常,モデル株内の調節標的が共通の遺伝的標的を持つ同じ種のメンバーの間で保存されるという仮定を通常する。著者らは最近,大腸菌のYhaJが2つの異なる病原型における病原性に重要であるが,それらのゲノムの異なる領域に結合し,共通の遺伝子を調節することを発見した。この驚くべき結果は,病原性調節の菌株特異的機構をもたらすが,他の大腸菌病原型または共生体に対する含意は不明である。ここでは,YhaJの不均一結合がE.coli種内に広まっていることを報告する。2つの条件下で4つの進化的に異なるE.coli分離株の全体的なYhaJ結合動力学を分析し,コアゲノム上の78の重要な部位と水平に取得した遺伝子座を明らかにした。YhaJの条件依存用量は,in vivoで占有部位数と相関したが,両条件に結合した領域でその濃縮を有意に変化させず,このTFが環境に応答してアクセサリー部位を占有する可能性を説明した。驚くべきことに,YhaJ結合部位のわずか15%だけが全株に共通であった。さらに,珍しい部位の濃縮の違いは,全ての株で見出される染色体領域で大きく観察され,DNA結合配列における株特異的水平獲得要素または変異への結合によって排他的に説明されなかった。この観察は,TF結合動力学における種内区別が広範な現象であり,菌株特異的遺伝子調節能を表すことを示唆する。IMPORTANCは細菌細胞,数百の転写因子が遺伝子調節を協調し,従って細胞過程の主要な駆動因子である。しかし,細菌ゲノム構造および含有量における大きな多様性は,調節ネットワークを解読する。これは,進化としてのモデル生物大腸菌に対して特に明らかであり,自然界で非常に異なるニッチを占める高度に異なるゲノムを有する種メンバーの出現を駆動した。転写因子は,細胞の調節ネットワークに水平に獲得されたDNAを統合しなければならないことはよく知られているが,単一モデル株を超えた調節多様性の程度は明らかではない。この概念を4つの進化的に異なる大腸菌株で探索し,高度に保存された転写因子が染色体結合部位において前例のない多様性を示すことを示した。重要なことに,この多様性は,結合部位における菌株特異的DNAまたは変異に限定されない。この観察は,菌株特異的調節ネットワークが個々の細菌種内で潜在的に広まっていることを示唆する。Please refer to the publisher for the copyright holders. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
