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J-GLOBAL ID：202002239521899604   整理番号：20A0203623

本質的に無秩序な蛋白質とそれらのファジー複合体の分子動力学に関する研究:ミニレビュー【JST・京大機械翻訳】

Studies on Molecular Dynamics of Intrinsically Disordered Proteins and Their Fuzzy Complexes: A Mini-Review

著者 (4件)： Kasahara Kota (College of Life Sciences, Ritsumeikan University, 1-1-1 Noji-higashi, Kusatsu, Shiga 525-8577, Japan) ,  Terazawa Hiroki (Graduate School of Life Sciences, Ritsumeikan University, 1-1-1 Noji-higashi, Kusatsu, Shiga 525-8577, Japan) ,  Takahashi Takuya (College of Life Sciences, Ritsumeikan University, 1-1-1 Noji-higashi, Kusatsu, Shiga 525-8577, Japan) ,  Higo Junichi (Graduate School of Simulation Studies, University of Hyogo, 7-1-28 Minatojima-minamimachi, Chuo-ku, Kobe 650-0047, Japan)
資料名： Computational and Structural Biotechnology Journal  (Computational and Structural Biotechnology Journal)
巻： 17  ページ： 712-720  発行年： 2019年 
JST資料番号： W3522A  ISSN： 2001-0370  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 文献レビュー  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 分子動力学(MD)法は,蛋白質とそれらのファジィ複合体の本質的に無秩序な領域(IDRs)の分子機構を解明するための有望なアプローチである。このミニレビューは,IDRの分子認識を研究するためにMDシミュレーションを適用する最近の研究を紹介する。まず第一に,MDシミュレーションがIDRを処理する方法論的問題,例えば,発展する力の場,周期的境界条件の処理,および強化されたサンプリング手法について議論する。次に,2種類の複合体形成に関するIDRの分子相互作用を調べるためにMDの応用のいくつかの例を示した。結合折畳みと結合およびファジィ複合体。MDシミュレーションは,柔軟なIDRの立体配座集合をサンプリングすることにより,これらの結合過程の分子機構への洞察を提供する。特に,IDRの高次集合の研究を除いて,全原子明示-溶媒MDシミュレーションに焦点を当てた。MD法における最近の進歩と計算力は,IDRの動的挙動を含む現実的な分子系の分子的詳細を解析することを可能にする。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 立体配座 ,  *タンパク質 ,  分子間相互作用 ,  *複合体 ,  シミュレーション ,  *分子動力学 ,  曖昧さ ,  分子系 ,  折畳み ,  分子認識 ,  力の場
準シソーラス用語： 動的挙動 ,  周期的境界条件 ,  分子機構 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (6件)： 蛋白質 ,  ファジー ,  複合体 ,  分子動力学 ,  研究 ,  レビュー