文献

J-GLOBAL ID：202002240075590842   整理番号：20A2508604

ケラチン細胞におけるスーパーオキシドジスムターゼ2(SOD2)の役割のためのオミクスに基づく研究:RNA配列決定,抗体チップアレイおよびバイオインフォマティクスアプローチ【JST・京大機械翻訳】

The omics based study for the role of superoxide dismutase 2 (SOD2) in keratinocytes: RNA sequencing, antibody-chip array and bioinformatics approaches

著者 (9件)： Li Hai-Long (Institute of Molecular Enzymology, Medical College of Soochow University, Suzhou, Jiangsu, PR China) ,  Lee Jae-Rin (Department of Molecular Cell Biology, Sungkyunkwan University School of Medicine, Suwon, South Korea) ,  Hahn Myong-Joon (Department of Molecular Cell Biology, Sungkyunkwan University School of Medicine, Suwon, South Korea) ,  Yang Jun-Mo (Department of Dermatology, Sungkyunkwan University School of Medicine, Samsung Medical Center, Seoul, South Korea) ,  Meng Fan-Guo (Institute of Molecular Enzymology, Medical College of Soochow University, Suzhou, Jiangsu, PR China) ,  Meng Fan-Guo (Redox Medical Center for Public Health, Soochow University, Suzhou, Jiangsu, PR China) ,  Wu Jia-Wei (Institute of Molecular Enzymology, Medical College of Soochow University, Suzhou, Jiangsu, PR China) ,  Park Yong-Doo (Department of Dermatology, Sungkyunkwan University School of Medicine, Samsung Medical Center, Seoul, South Korea) ,  Park Yong-Doo (Skin Diseases Research Center, Yangtze Delta Region Institute of Tsinghua University, Jiaxing, PR China)
資料名： Journal of Biomolecular Structure and Dynamics  (Journal of Biomolecular Structure and Dynamics)
巻： 38  号： 10  ページ： 2884-2897  発行年： 2020年 
JST資料番号： W5935A  ISSN： 0739-1102  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本研究では,ヒトケラチン細胞におけるスーパーオキシドジスムターゼ2(SOD2)に関連する重要な因子を,遺伝子および蛋白質発現プロファイリングアプローチを通して同定することを目的とした。組換えSOD2を培養培地に外因的に添加した後,著者らは,ケラチン細胞におけるSOD2と関連する遺伝子および蛋白質を明らかにするために,RNA配列決定分析,統合抗体-チップアレイおよびバイオインフォマティクスアルゴリズムの実装を含む連続OMICS研究を行った。これらのアプローチは外因性SOD2と関連するケラチン細胞におけるいくつかの新規遺伝子と蛋白質を同定した。これらの新規遺伝子はDCTを含み,上方制御され,CD38,GPR151,HCK,KITおよびAFPはダウンレギュレートされた。それらの中で,CD38とKITもPPIマッピングにおけるハブ蛋白質として予測された。これらの相補的ハイスループットOMICS研究から得られたデータセットを統合し,各方法の強度を利用して,皮膚細胞における外部添加SOD2の機能的役割およびSOD2関連皮膚機能において重要な役割を果たすと考えられるいくつかの重要な遺伝子への新しい洞察を得た。ここで用いたアプローチは,SOD2関連応用の著者らの臨床的理解に寄与することができ,広範囲の疾患に広く応用可能である。Abbrevation:SOD2スーパーオキシドジスムターゼ2DAVIDは,注釈,可視化,および統合発見KEGGKyoto Encyclopedia of Genes and Genomes PPI蛋白質-蛋白質相互作用HTS High-スループットスクリーニングCommuniated of Ramswamy H.Sarmaによる。Please refer to the publisher for the copyright holders. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アルゴリズム ,  *RNA【核酸】 ,  遺伝子 ,  *抗体 ,  タンパク質 ,  ヒト ,  可視化 ,  アップレギュレーション ,  *ケラチン細胞 ,  CD38抗原
準シソーラス用語： *バイオインフォマティクス ,  蛋白質間相互作用 ,  ハイスループット ,  蛋白質発現 ,  *オミックス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (1件)： キーワード:SOD2;マイクロアレイ;ケラチノサイト;RNA配列決定;抗体アレイ; PPIマッピング;オミクス

分類 (4件)： 皮膚の基礎医学  (GF01020Y) ,  外皮一般  (EJ11010C) ,  細胞生理一般  (EF02010S) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (9件)： ケラチン細胞 ,  スーパーオキシドジスムターゼ2 ,  SOD2 ,  役割 ,  オミクス ,  研究 ,  RNA ,  抗体チップ ,  アレイ