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J-GLOBAL ID：202002240307004357   整理番号：20A0789535

南極から分離したPseudomonas spp.とJanthinobacterium spp.におけるポリヒドロキシアルカン酸(PHA)シンターゼ遺伝子とPHA関連遺伝子クラスタ【JST・京大機械翻訳】

Polyhydroxyalkanoate (PHA) synthase genes and PHA-associated gene clusters in Pseudomonas spp. and Janthinobacterium spp. isolated from Antarctica

著者 (8件)： Tan Irene Kit Ping (Institute of Biological Sciences, Faculty of Science, University of Malaya, 50603 Kuala Lumpur, Malaysia) ,  Foong Choon Pin (Ecobiomaterial Research Laboratory, School of Biological Sciences, Universiti Sains Malaysia, 11800 USM, Pulau Pinang, Malaysia) ,  Tan Hua Tiang (Ecobiomaterial Research Laboratory, School of Biological Sciences, Universiti Sains Malaysia, 11800 USM, Pulau Pinang, Malaysia) ,  Lim Hui (Ecobiomaterial Research Laboratory, School of Biological Sciences, Universiti Sains Malaysia, 11800 USM, Pulau Pinang, Malaysia) ,  Zain Noor-Afiqah Ahmad (Ecobiomaterial Research Laboratory, School of Biological Sciences, Universiti Sains Malaysia, 11800 USM, Pulau Pinang, Malaysia) ,  Tan Yung Chie (Department of Science and Technology, Codon Genomics S/B, Taman Dutamas, Balakong, 43200 Seri Kembangan, Malaysia) ,  Hoh Chee Choong (Department of Science and Technology, Codon Genomics S/B, Taman Dutamas, Balakong, 43200 Seri Kembangan, Malaysia) ,  Sudesh Kumar (Ecobiomaterial Research Laboratory, School of Biological Sciences, Universiti Sains Malaysia, 11800 USM, Pulau Pinang, Malaysia)
資料名： Journal of Biotechnology  (Journal of Biotechnology)
巻： 313  ページ： 18-28  発行年： 2020年 
JST資料番号： A0456C  ISSN： 0168-1656  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 南極から分離された4つの細菌株のポリヒドロキシアルカン酸(PHA)生産能力を以前の研究で報告した。本研究は,全ゲノム配列分析を通して,2つの南極Pseudomonas分離株(UMAB-08とUMAB-40)と2つの南極Janthinobacterium分離株(UMAB-56とUMAB-60)からPHAシンターゼ遺伝子とPHA関連遺伝子クラスタを分析した。Pseudomonas分離株は,短鎖長PHA(scl-PHA)と中鎖長PHA(MCL-PHA)の生合成に関与する2つの異なるPHA遺伝子クラスタ,すなわちクラスIとクラスIIに低下するPHAシンターゼ遺伝子を運ぶことが分かった。一方,Janthinobacterium分離株はクラスI及び非特性化推定PHAシンターゼ遺伝子を保持した。PHA合成に関与する他の遺伝子は,Janthinobacterium分離株における非特性化推定PHAシンターゼ遺伝子に近い近くで検出され,従って,PHAシンターゼ(PhaC)系統樹の通常クラスI,II,III及びIVクレードから分離クレードに落ちた。多重配列アラインメントは,特性化されていない推定PHAシンターゼ遺伝子がすべての高度に保存されたアミノ酸残基とPHAシンターゼの提案された触媒トリアドを含むことを示した。PHA生合成とin vitro PhaC酵素アッセイの結果は,Janthinobacterium種UMAB-60からのこの非特性化推定PHAシンターゼが機能的であることを示した。本報告では,PHAシンターゼ遺伝子について,PHAシンターゼ遺伝子およびPHA関連遺伝子クラスターの情報を,南極細菌分離株(極端および地理的に分離された環境)から記述し,非南極PHA生産細菌からのそれらと比較することにより,PHAシンターゼデータベースに対する新しい知識を加えた。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  細菌 ,  生合成 ,  *遺伝子 ,  系統樹 ,  *Pseudomonas ,  アミノ酸残基 ,  in vitro実験 ,  *合成酵素
準シソーラス用語： ポリヒドロキシアルカン酸シンターゼ ,  ゲノム配列 ,  *遺伝子クラスタ ,  クレード ,  鎖長 ,  分離株 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 南極細菌 ,  PHAオペロン ,  PHAシンターゼ ,  ポリヒドロキシアルカン酸(PHA) ,  全ゲノム配列決定

分類 (4件)： 代謝と栄養  (EG03054K) ,  遺伝子操作  (EC02050B) ,  微生物代謝産物の生産  (FK03020A) ,  ポリエステル,アルキド  (YH07070P)

タイトルに関連する用語 (9件)： 南極 ,  Pseudomonas ,  SPP ,  Janthinobacterium ,  ポリヒドロキシアルカン酸 ,  PHA ,  シンターゼ ,  遺伝子 ,  遺伝子クラスタ