文献

J-GLOBAL ID：202002240776500095   整理番号：20A0594437

鼻咽頭ミクロビオームの存在量は百日咳の診断に影響し,細菌培養とリアルタイムPCRの間の感度差を説明する【JST・京大機械翻訳】

Abundance of the nasopharyngeal microbiome effects pertussis diagnosis and explains the sensitivity difference between bacterial culture and real-time PCR

著者 (5件)： Ding Yijun (Department of Neonatology, Beijing Children’s Hospital, Capital Medical University, National Center for Children’s Health, Beijing, China) ,  Wang Qing (Beijing Pediatric Research Institute, Beijing Children’s Hospital, Capital Medical University, National Center for Children’s Health, Beijing, China) ,  Li Dongfang (Department of Microbial Research, WeHealthGene, Shenzhen, China) ,  Yao Kaihu (Beijing Pediatric Research Institute, Beijing Children’s Hospital, Capital Medical University, National Center for Children’s Health, Beijing, China) ,  Wang Tianyou (Department of Hematology and Oncology, Beijing Children’s Hospital, Capital Medical University, National Center for Children’s Health, Beijing, China)
資料名： European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases  (European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases)
巻： 39  号： 3  ページ： 501-507  発行年： 2020年 
JST資料番号： T0158A  ISSN： 0934-9723  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 定量的リアルタイムPCR(qPCR)は百日咳診断に使用される。qPCRの陽性率は一般的に細菌培養のそれよりはるかに高く,混乱を引き起こす可能性がある。本研究では,16SリボソームRNA(16S rRNA)配列決定を用いて,従来の培養とqPCRの間の相関を評価し,百日咳の診断における16S rRNAの値を調査した。百日咳に対する臨床診断基準を満たす102人の子供から集めた鼻咽頭スワブをBordetella百日咳培養とqPCRにかけた。生物情報学的微生物相分析は,16S rRNA V3-V4遺伝子配列決定に基づいた。102の試料のうち,14(13.7%)はBordetella百日咳に対して培養陽性であったが,61(59.8%)はqPCR陽性であった。Bordetella属は16S rRNA配列決定により68(66.7%)試料で同定された。Bordetella属の相対存在量が0.70%を超えたとき,qPCRと培養結果の両方が陽性であった。0.20%未満の相対存在量を有する試料は,陽性qPCRと陰性培養結果を示した。低Bordetella豊度を持つ試料は,実験室試験における培養とqPCR結果の間の悪い相関の基礎となる重要な因子である。Copyright Springer-Verlag GmbH Germany, part of Springer Nature 2019 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ミクロフローラ ,  Bordetella ,  子供 ,  *百日咳 ,  百日咳菌 ,  定量的PCR法 ,  *リアルタイムPCR法
準シソーラス用語： 遺伝子配列 ,  バイオインフォマティクス ,  スワブ ,  臨床診断 ,  16S rRNA ,  *細菌培養 ,  *常在菌叢ゲノム ,  *鼻咽頭 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 百日咳菌 ,  診断 ,  感度 ,  文化 ,  定量的リアルタイムPCR

分類 (1件)： 感染症・寄生虫症一般  (GD01010H)

タイトルに関連する用語 (8件)： 鼻咽頭 ,  ミクロビオーム ,  百日咳 ,  診断 ,  細菌培養 ,  リアルタイムPCR ,  感度 ,  説明