文献

J-GLOBAL ID：202002241170469936   整理番号：20A0627416

膀胱癌の腫瘍微小環境における重要な予後遺伝子をスクリーニングするためのバイオインフォマティクス分析【JST・京大機械翻訳】

Bioinformatics Analysis to Screen the Key Prognostic Genes in Tumor Microenvironment of Bladder Cancer

著者 (6件)： Zhang Zhao ( Department of Urology, Qilu Hospital of Shandong University, Wenhuaxi Road 107#, Jinan 250012, China) ,  Chen Dongshan ( Department of Urology, Qilu Hospital of Shandong University, Wenhuaxi Road 107#, Jinan 250012, China) ,  Li Zeyan ( Department of Urology, Qilu Hospital of Shandong University, Wenhuaxi Road 107#, Jinan 250012, China) ,  Liu Zhao ( Department of Urology, Qilu Hospital of Shandong University, Wenhuaxi Road 107#, Jinan 250012, China) ,  Yan Lei ( Department of Urology, Qilu Hospital of Shandong University, Wenhuaxi Road 107#, Jinan 250012, China) ,  Xu Zhonghua ( Department of Urology, Qilu Hospital of Shandong University, Wenhuaxi Road 107#, Jinan 250012, China)
資料名： BioMed Research International (Web)  (BioMed Research International (Web))
巻： 2020  ページ： Null  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7008A  ISSN： 2314-6133  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 膀胱癌(BLCA)は,第5の最も一般的な癌であり,低い生存率と高い罹患率と死亡率の特徴を持っている。癌ゲノムAtlas(TCGA)は,グローバルな遺伝子発現プロファイルのプールであり,膨大な量の癌ゲノミクスデータを含んでいる。それは,BLCAを含む一連の悪性腫瘍の遺伝子発現と予後の間の関係を調査することを可能にする。免疫および間質細胞は,腫瘍の予後を判断し,悪性,炎症性および代謝性疾患の進行に影響を及ぼすことにおいて重要な役割を果たす腫瘍微小環境(TME)の2つの主要成分である。本研究では,ESTIMATEアルゴリズムに基づいて免疫および間質要素の定量分析を行い,BLCA症例を高および低群に分割した。次に,グループ間の腫瘍予後に密接に関連する差次的に発現した遺伝子を同定し,免疫応答および間質変化と相関することを示し,機能的濃縮分析および蛋白質-蛋白質相互作用ネットワークによりさらに確認した。著者らは,ArrayExpressからダウンロードされたBLCAデータを通してこれらの遺伝子を検証し,したがって,BLCAの予後を予測するためのマーカー遺伝子を得た。加えて,免疫細胞浸潤分析は,検証された遺伝子と免疫細胞の間の相関を調査した。結論として,著者らは,予後を評価し,TMEと腫瘍予後の間の相互作用を調査し,臨床的に個別化した治療をガイドするために,一連のTME関連遺伝子を同定した。Copyright 2020 Zhao Zhang et al. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝子発現 ,  細胞浸潤 ,  間質組織 ,  ネットワーク ,  生存率 ,  *予後 ,  相互作用 ,  炎症 ,  *腫瘍 ,  間質細胞 ,  アルゴリズム ,  *膀胱腫瘍 ,  *遺伝子 ,  免疫反応 ,  死亡率

分類 (1件)： 腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N)

引用文献 (55件)：

• C. Berdik, "Unlocking bladder cancer," Nature, vol. 551, no. 7679, pp. S34-S35, 2017.
• J. Qiu, X. Wang, X. Meng et al., "Attenuated NER expressions of XPF and XPC associated with smoking are involved in the recurrence of bladder cancer," PLoS One, vol. 9, no. 12, 2014.
• P. Costa-Pinheiro, D. Montezuma, R. Henrique, C. Jerónimo, "Diagnostic and prognostic epigenetic biomarkers in cancer," Epigenomics, vol. 7, no. 6, pp. 1003-1015, 2015.
• H.-T. Li, C. E. Duymich, D. J. Weisenberger, G. Liang, "Genetic and epigenetic alterations in bladder cancer," International Neurourology Journal, vol. 20, no. 2, pp. S84-S94, 2016.
• X. Zhang, Y. Zhang, "Bladder cancer and genetic mutations," Cell Biochemistry and Biophysics, vol. 73, no. 1, pp. 65-69, 2015.

タイトルに関連する用語 (7件)： 膀胱癌 ,  腫瘍微小環境 ,  予後 ,  遺伝子 ,  スクリーニング ,  バイオインフォマティクス ,  分析