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J-GLOBAL ID：202002241284607400   整理番号：20A2253665

大規模解析は原発性膠芽腫における生存予測のための遺伝子シグネチャを明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Large-Scale Analysis Reveals Gene Signature for Survival Prediction in Primary Glioblastoma

著者 (3件)： Prasad Birbal (National Horizons Centre, School of Health and Life Sciences, Teesside University, Darlington, UK) ,  Tian Yongji (Beijing Tiantan Hospital, Capital Medical University, Beijing, People’s Republic of China) ,  Li Xinzhong (National Horizons Centre, School of Health and Life Sciences, Teesside University, Darlington, UK)
資料名： Molecular Neurobiology  (Molecular Neurobiology)
巻： 57  号： 12  ページ： 5235-5246  発行年： 2020年 
JST資料番号： W0110A  ISSN： 0893-7648  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： グリア芽細胞腫(GBM)は,最も悪性で一般的な原発性中枢神経系腫瘍である。広範な治療にもかかわらず,GBM患者は通常12~15か月の生存期間中央値で予後不良である。生存予測を改善し,治療戦略で支援できる新しい分子バイオマーカーはまだ緊急に必要である。ここでは,原発性GBM患者における生存予測を改善する遺伝子シグネチャパネルをロバストに同定することを目的とした。955の試料(我々の知る限り,そのような研究に対する1次GBMコホート)と165のサンプルを有するRNA-seqデータセットからの3368のDEGからなるマイクロアレイデータセットのメタ分析を用いて,2166の差次的発現遺伝子(DEG)を同定した。多変量Cox回帰による単変量Coxおよび最小絶対収縮および選択オペレータ(LASSO)を用いて,1443の共通DEGに基づいて,著者らは,IGFBP2,PTPRN,STEAP2およびSLC39A10を含む生存関連4遺伝子シグネチャパネルを同定し,その後生存予測において良好に機能したリスクスコアモデルを確立した。高リスク群患者は,低リスク群(1年予測に対するAUC=0.766)と比較して,生存率が有意に不良であった。多変量解析は,4遺伝子シグネチャパネルの予測値が他の臨床的および病理学的特徴とは無関係であり,従って潜在的予後バイオマーカーであることを示した。さらに重要なことに,3つの独立したGBMコホートにおけるこの署名を検証し,その普遍性を試験した。結論として,メタ分析アプローチを用いた統合分析は,利用可能な遺伝子発現データの使用を最大化し,一次GBMの生存を予測するための4遺伝子パネルをロバストに同定する。Copyright The Author(s) 2020 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 多変量解析 ,  オペレータ ,  *遺伝子 ,  生存率 ,  予後 ,  母集団 ,  ロバスト性 ,  治療計画 ,  普遍性 ,  バイオマーカー ,  メタ分析 ,  DNAマイクロアレイ ,  *膠芽腫
準シソーラス用語： 予後不良 ,  遺伝子発現データ , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 神経膠芽腫 ,  予後 ,  バイオマーカー ,  生存解析 ,  Meta分析

分類 (1件)： 神経系の腫よう  (GN04000V)

タイトルに関連する用語 (7件)： 大規模解析 ,  原発 ,  膠芽腫 ,  生存 ,  予測 ,  遺伝子 ,  シグネチャ