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J-GLOBAL ID：202002241826203257   整理番号：20A0331410

頸動脈アテローム性動脈硬化症ウサギモデルにおいて機能的lncRNAを明らかにするlncRNA発現プロファイルおよびアテローム性動脈硬化関連lncRNA-mRNAネットワークの系統的解析【JST・京大機械翻訳】

Systematic analysis of lncRNA expression profiles and atherosclerosis-associated lncRNA-mRNA network revealing functional lncRNAs in carotid atherosclerotic rabbit models

著者 (9件)： Wu Yingnan (Department of Ultrasound, The Second Affiliated Hospital of Harbin Medical University, Harbin, China) ,  Zhang Feng (Department of Ultrasound, The Second Affiliated Hospital of Harbin Medical University, Harbin, China) ,  Li Xiaoying (Department of Ultrasound, The Second Affiliated Hospital of Harbin Medical University, Harbin, China) ,  Hou Wenying (Department of Ultrasound, Xuanwu Hospital Capital Medical University, Beijing, China) ,  Zhang Shuang (Department of Ultrasound, The Second Affiliated Hospital of Harbin Medical University, Harbin, China) ,  Feng Yanan (Department of Ultrasound, The Second Affiliated Hospital of Harbin Medical University, Harbin, China) ,  Lu Rui (Department of Ultrasound, The Second Affiliated Hospital of Harbin Medical University, Harbin, China) ,  Ding Yu (Department of Bioinformatics, Harbin Medical University, Harbin, China) ,  Sun Litao (Department of Ultrasound, The Second Affiliated Hospital of Harbin Medical University, Harbin, China)
資料名： Functional & Integrative Genomics  (Functional & Integrative Genomics)
巻： 20  号： 1  ページ： 103-115  発行年： 2020年 
JST資料番号： W4378A  ISSN： 1438-7948  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 多因子性および慢性免疫性炎症性疾患であるアテローム性動脈硬化症は,多発性心血管疾患の主な原因である。最近,研究者は,lncRNAがアテローム性動脈硬化症(AS)の進行において重要な機能を発揮する可能性があることを報告した。いくつかの研究は,lncRNAが一般的なmiRNA応答要素の競合によって相互に相互作用するためにceRNAとして作用することができることを見出した。しかし,アテローム性動脈硬化症に関するlncRNA関連ceRNAネットワークは限られている。本研究では,lncRNA-mRNAネットワークを構築し,系統的に分析し,頚動脈アテローム硬化性ウサギモデルにおけるその潜在的役割を明らかにした。アテローム性動脈硬化症は,高脂肪食とバルーン損傷によりウサギ(n=3)頸動脈で誘導され,一方,年齢をマッチさせたウサギ(n=3)は,対照として正常な選択で治療された。RNA-seq分析は,プラーク形成の有無にかかわらずウサギ頸動脈(n=6)で行われた。ceRNA機構に基づいて,lncRNA,mRNAおよびmiRNAを含む三成分相互作用ネットワークを生成し,AS関連lncRNA-mRNAネットワーク(ASLMN)を抽出した。さらに,ASLMNの特性を分析し,6つのlncRNA(MSSTG,10603.16,5258.4,12799.3,5352.1,12022.1,12250.4)がトポロジー解析を通してASに高度に関連していることを発見した。GOとKEGG濃縮分析により,lncRNA MSTRG5258.4は,T細胞受容体シグナル伝達経路を介してASにおけるダウンレギュレーションされた役割をダウンレギュレーションし,THBS1をダウンレギュレーションし,ECM受容体相互作用経路を介してASにおけるアップレギュレーション機能を行うことを示した。最後に,著者らの結果はASの開始と進行におけるlncRNAの重要な機能を解明した。著者らは,ウサギの頚動脈におけるアテローム性動脈硬化症発生のASLMNと,臨床応用の将来研究のための基礎を置く可能性のある標的を提供した。Copyright Springer-Verlag GmbH Germany, part of Springer Nature 2019 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *アテローム性動脈硬化症 ,  *mRNA ,  アップレギュレーション ,  ダウンレギュレーション ,  相互作用 ,  受容体 ,  位相幾何学 ,  心血管疾患 ,  *動脈硬化症 ,  *頚動脈 ,  *ネットワーク ,  高脂肪食 ,  *RNA【核酸】 ,  T細胞受容体
準シソーラス用語： *非翻訳長鎖RNA , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： LncRNA ,  動脈硬化 ,  RNA-seq ,  ネットワーク解析 ,  頚動脈アテローム性動脈硬化症ウサギモデル

分類 (1件)： 循環系の基礎医学  (GJ01020K)

タイトルに関連する用語 (9件)： 頸動脈 ,  アテローム性動脈硬化症 ,  ウサギモデル ,  lncRNA ,  発現プロファイル ,  アテローム性動脈硬化 ,  mRNA ,  系統 ,  解析