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J-GLOBAL ID:202002241849310624   整理番号:20A2519373

水和ランレオチド系誘導体の力場シミュレーション:二量体における自己集合の水和,動力学および数値的証拠【JST・京大機械翻訳】

Force-Field Simulations of a Hydrated Lanreotide-Based Derivative: Hydration, Dynamics, and Numerical Evidence of Self-Assembly in Dimers
著者 (3件):
資料名:
巻:号: 39  ページ: 25423-25431  発行年: 2020年 
JST資料番号: W5044A  ISSN: 2470-1343  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: アメリカ合衆国 (USA)  言語: 英語 (EN)
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最近,二量体構造からナノチューブ中の環状オクタペプチドランレオチドとランレオチド系誘導体の自己組織化が実験的に証明された。両単量体間の相互作用の性質は,モノマーの水和の分子的詳細が全く調べられていないが,二量体の形成が提供された。分子動力学シミュレーションを用いて,本研究では,水およびランレオチドの類似体の構造,水和および動力学に焦点を当てた。そのために,部分電荷と静電相互作用計算の種々のスキームに基づく単量体のいくつかのモデルを考察した。実験と比較して,AMBER力場,CHELPG電荷計算,Ewald和の組合せに基づくモデルが,最も関連することを示した。さらに,ランレオチド単量体の界面水和をマッピングすることにより,不均一水和を含む親水性に関して不均一表面を証明した。さらに,ランレオチド表面に近い水分子の並進動力学における減速を示した。また,構造,水和,およびエネルギーの観点から二量体における自己集合の分子の詳細を提供した。Copyright 2020 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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分類 (2件):
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分子化合物  ,  蛋白質・ペプチド一般 

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