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J-GLOBAL ID：202002241890947324   整理番号：20A0037252

20162017年深セン地区のコクサッキーウイルスA16型分子特徴分析【JST・京大機械翻訳】

Genetic characteristics of coxsackievirus A16 isolated in Shenzhen from 2016 to 2017

著者 (10件)： Yao Xiangjie (深zhen市疾病預防控制中心病原生物研究所 518055) ,  Wang Weiqi (广東医科大学研究生院,東莞,523808) ,  Chen Long (深zhen市疾病預防控制中心病原生物研究所 518055) ,  Yang Hong (深zhen市疾病預防控制中心病原生物研究所 518055) ,  Meng Jun (深zhen市疾病預防控制中心病原生物研究所 518055) ,  Pan Hong (深zhen先進技術研究院生物医薬与技術研究所,518055) ,  Zhang Hailong (深zhen市疾病預防控制中心病原生物研究所 518055) ,  Zhang Hongyu (深zhen市疾病預防控制中心病原生物研究所 518055) ,  Zhang Renli (深zhen市疾病預防控制中心病原生物研究所 518055) ,  He Yaqing (深zhen市疾病預防控制中心病原生物研究所 518055)
資料名： Zhonghua Weishengwuxue he Mianyixue Zazhi  (Zhonghua Weishengwuxue he Mianyixue Zazhi)
巻： 39  号： 9  ページ： 652-656  発行年： 2019年 
JST資料番号： C2322A  ISSN： 0254-5101  CODEN： ZWMZDP  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 目的:深セン市の20162017年に手足口病の症例由来のコクサッキーウイルスA群16型(Cox-sackievirusA16,CVA16)のVP1遺伝子特徴を分析し、その分子疫学的特徴を解明する。方法:20162017年の深セン地区のセンチネル病院手足口病サンプルを収集し、蛍光RT-PCRを用いてCVA16陽性サンプルをスクリーニングし、そのうち51のサンプルからVP1配列の増幅とシークエンシングを行い、さらにMEGA6.02、BioEdit、Editなどを用いた。DNAStarなどのバイオインフォマティクスソフトウェアを比較分析した。結果:20162017年の深セン地区のCVA16進化群は主にB1a亜型、B1b亜型に分けられ、また新たに発見されたB3亜型がある。B1b流行株は20162017年に分布した(2016年28株,2017年19株)。B1a流行株は2017年(計2株)にのみ分布し、また、2017年深センに2株B3亜型CVA16流行株を発見した。2016と2017年のCVA16B1b亜型は,中国東部のJQ341149上海株,KP289416温州株,および中国北部のKU254598北京株と近縁であった。2017年のB1a亜型は中国南西昆明地区のJQ316639Kunmin2011株とタイのGQ184139Tailand2005との近縁関係が近い。そのうち、B3亜型は中国大陸で最近出現したCVA16流行株である。さらに、深セン地区の2016-2017年のCVA16流行株と神経症状を引き起こすCVA16の重症株を比較すると、2つのアミノ酸突然変異部位が発見され、それぞれVP1蛋白のS14NとM23Lであった。【結語】2016年のCVA16の流行株はB1bサブタイプであり,2017年にはB1aサブタイプとB1bサブタイプ,および新たに発見されたB3亜型株を含む,CVA16の重症株が,CVA16の神経症状を発症するのに対して,B1aサブタイプ,B1bサブタイプ,およびB3サブタイプを含む。深センの2016-2017年のCVA16流行株VP1タンパク質は2つのアミノ酸突然変異を共有し、その中のS14N部位は線形B細胞エピトープ領域に位置する。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *コクサッキーウイルス ,  神経症状 ,  突然変異 ,  蛍光 ,  手足口病 ,  アミノ酸 ,  RT-PCR法 ,  中国北部 ,  線形性 ,  ソフトウェア
準シソーラス用語： サブタイプ ,  バイオインフォマティクス ,  配列解析 ,  分子疫学 ,  VP1蛋白質 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Coxsackievirus A16 ,  Hand ,  foot and mouth disease ,  Phylogenetic analysis

分類 (3件)： ウイルス感染の生理と病原性  (EG04042Y) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (5件)： 深セン ,  地区 ,  コクサッキーウイルスA16 ,  分子 ,  特徴分析